针对您提出的问题，我首先给出明确结论：
- 公司签订未审定小麦种回收合同是否违法：这取决于具体情境，若公司明知种子未审定仍销售并签订回收合同，可能构成违法，需承担相应法律责任。
- 购种款能否要回：农户在特定条件下有权要求公司退还购种款，如合同无效或公司存在违约行为。
- 损失如何处理：农户的损失赔偿需根据合同条款、公司行为及法律规定综合判断。
接下来，我将从不同角度详细分析这些问题：
一、公司签订未审定小麦种回收合同是否违法
法律背景：
- 根据《中华人民共和国种子法》的相关规定，主要农作物品种在推广前应当通过国家级或者省级审定。未经审定的品种，不得发布广告、推广、销售。
- 若公司明知小麦种子未审定仍进行销售，并与农户签订回收合同，这一行为可能违反了种子法的相关规定，构成违法。
法律后果：
- 公司可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 若因销售未审定种子给农户造成损失，公司还需承担民事赔偿责任。
二、购种款能否要回
合同无效情形：
- 如果合同因违反法律、行政法规的强制性规定而无效（如销售未审定种子），根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，农户有权要求公司退还购种款。
公司违约情形：
- 若合同有效，但公司未按约定提供符合质量标准的种子或未按约定回收小麦，构成违约，农户也有权要求公司退还购种款或承担其他违约责任。
三、损失如何处理
损失赔偿原则：
- 农户的损失赔偿应遵循“填平原则”，即赔偿范围应限于农户因公司行为而遭受的实际损失。
损失计算与证据：
- 农户需提供证据证明其损失，如购买种子的发票、因种子问题导致的减产或绝收证明等。
- 损失计算可能包括：购种款、因减产或绝收导致的收入减少、为补救损失而支出的合理费用等。
合同条款与责任分担：
- 若合同中有关于损失赔偿的条款，应按合同约定处理。
- 若合同无约定或约定不明，则根据法律规定和实际情况，由双方协商或通过法律途径确定责任分担。
最后，我给出一些建议：
- 农户方面：在签订合同时，应仔细阅读合同条款，了解种子的审定情况、质量标准、回收条件等关键信息。如发现公司存在违法行为或违约行为，应及时收集证据并寻求法律帮助。
- 公司方面：应严格遵守种子法等相关法律法规，确保销售的种子经过审定并符合质量标准。在签订合同时，应明确双方的权利义务和违约责任，以减少纠纷的发生。
若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。