结论：公司与农户签订未审定的小麦种合同，主要违背了《种子法》中关于种子审定和经营许可的相关规定，同时也可能违反《民法典》中关于合同效力及民事法律行为效力的相关规定。
一、《种子法》相关规定
种子审定制度：
- 根据《种子法》的相关规定，主要农作物品种在推广前应当通过国家级或者省级审定。未审定通过的主要农作物品种，不得发布广告、推广、销售。因此，公司与农户签订未审定的小麦种合同，直接违反了种子审定制度。
种子经营许可：
- 《种子法》还规定，从事种子经营活动的单位和个人，应当取得种子经营许可证。如果公司未取得相应的种子经营许可证，而擅自经营未审定的小麦种，这也构成了违法行为。
二、《民法典》相关规定
合同效力：
- 根据《民法典》的规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。由于公司与农户签订的合同涉及未审定的小麦种，这违反了《种子法》的强制性规定，因此该合同可能被认定为无效合同。
民事法律行为效力：
- 同样地，根据《民法典》关于民事法律行为效力的规定，如果民事法律行为的内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，那么该民事法律行为也是无效的。在此情况下，公司与农户签订未审定小麦种的合同，不仅违反了《种子法》，也可能违背了农业生产的公序良俗，因此该合同行为无效。
三、法律后果与建议
法律后果：如果合同被认定为无效，那么公司可能需要承担返还财产、赔偿损失等民事责任。同时，如果公司的行为还构成了行政违法，那么还可能面临农业行政主管部门的行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
建议：对于公司而言，应当严格遵守《种子法》的相关规定，确保所经营的种子已经通过审定并取得相应的经营许可证。对于农户而言，在签订种子购买合同时，应当仔细审查合同内容，确保所购买的种子是合法、合规的。如果发现公司存在违法行为，农户可以向农业行政主管部门举报或者通过法律途径维护自己的合法权益。
四、进一步思考
- 在实际操作中，如何判断种子是否已经通过审定？农户可以要求公司出示种子的审定证书或者查询相关农业行政主管部门的官方网站进行确认。
- 如果合同被认定为无效，那么双方已经履行的部分如何处理？这需要根据具体情况进行判断，可能涉及到返还财产、赔偿损失等民事责任的承担。
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