结论概述：

1. 关于合同违法性：公司和农户签订未审定的小麦种回收合同，其违法性需结合具体法律法规及合同条款来判断。若合同内容违反法律强制性规定或公序良俗，则可能被认定为违法。
2. 关于农户购种款退回：农户能否退回购种款，取决于合同效力、违约责任及双方协商情况。若合同无效或被撤销，农户有权要求退款；若合同有效但公司违约，农户可依据合同条款或法律规定要求赔偿，包括购种款。

详细分析：

一、合同违法性判断

1. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国种子法》等相关法律法规，种子生产、经营需取得相应许可，且种子需经过审定或登记方可推广销售。若公司未取得相关许可或销售未审定的小麦种，则可能违反法律规定。
   • 合同内容若违反法律强制性规定（如禁止销售未审定种子）或公序良俗，则可能被认定为无效合同。

2. 合同条款审查：

   • 需审查合同中关于种子来源、审定情况、质量标准、回收条款等具体内容，以判断合同是否合法有效。
   • 若合同中明确约定销售未审定种子，且双方均知情并同意，该条款可能因违反法律强制性规定而无效，但不影响合同其他部分的效力（除非其他部分也违法）。

二、农户购种款退回问题

1. 合同无效或被撤销：

   • 若合同因违反法律强制性规定或公序良俗而被认定为无效，农户有权要求公司返还购种款，并可能要求赔偿因此造成的损失。
   • 若合同因欺诈、胁迫等手段订立，农户有权请求人民法院或仲裁机构撤销合同，并要求公司返还购种款及赔偿损失。

2. 合同有效但公司违约：

   • 若合同有效，但公司未按约定提供符合质量标准的种子或未按约定回收小麦，则构成违约。
   • 农户可依据合同条款或《中华人民共和国民法典》中关于违约责任的规定，要求公司承担违约责任，包括继续履行、采取补救措施或赔偿损失等。其中，赔偿损失可包括购种款及因违约造成的其他直接损失。

3. 双方协商：

   • 在任何情况下，双方均可通过协商解决争议。若公司同意退款或赔偿，且农户接受，则可通过协商达成和解。

三、建议与行动步骤

1. 收集证据：

   • 农户应收集与合同签订、履行相关的所有证据，包括合同文本、付款凭证、种子样品、通信记录等。

2. 咨询专业律师：

   • 鉴于法律问题的复杂性，建议农户咨询专业律师（即向我咨询），以获取针对具体案情的法律意见和诉讼策略。

3. 考虑法律途径：

   • 若协商无果，农户可考虑通过法律途径解决争议，包括向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。

四、注意事项：

• 农户在签订合同时应仔细阅读合同条款，确保了解并同意所有内容。
• 在发现公司可能存在违法行为时，应及时向相关部门举报并保留证据。
• 在处理此类纠纷时，应保持冷静和理性，避免采取过激行为导致损失扩大。