结论：公司没有员工，一般情况下不会被相关部门主动“查”，但在特定情况下，如涉及税务、社保等合规问题，或者存在其他违法违规行为时，可能会受到相关部门的调查。
分析说明：
日常监管角度：
- 在日常的监管活动中，相关部门（如劳动监察部门）通常不会主动对没有员工的公司进行调查。因为这类公司没有雇佣行为，也就不存在劳动纠纷、社保缴纳等常见问题。
- 然而，如果公司虽然名义上没有员工，但实际上存在非法用工（如使用未签订劳动合同的临时工、实习生等未纳入社保体系的人员），或者存在其他违法违规行为，那么一旦被发现或举报，就可能会受到相关部门的调查。
税务和社保合规角度：
- 即使公司没有员工，也需要按照法律规定进行税务和社保的申报。例如，公司需要申报企业所得税、增值税等税种，即使没有应税收入也需要进行零申报。
- 在社保方面，虽然公司没有员工，但如果公司有法人或其他相关人员需要缴纳社保（如某些地区的法人必须缴纳社保），那么公司也需要按照规定进行社保的缴纳和申报。
- 如果公司未按照规定进行税务和社保的申报和缴纳，那么税务和社保部门有权对公司进行调查，并可能对公司进行处罚。
其他违法违规行为：
- 除了税务和社保合规问题外，如果公司存在其他违法违规行为（如虚假注册、非法经营等），那么相关部门也有权对公司进行调查。
- 这些调查可能基于举报、投诉、抽查等多种原因进行，与公司是否有员工无直接关系。
行动建议：
- 合规经营：无论公司是否有员工，都应确保公司的经营活动符合法律法规的要求，包括税务、社保、工商等方面的规定。
- 定期自查：建议公司定期进行自查，确保公司的各项经营活动都合法合规，避免因为疏忽或无知而引发法律风险。
- 及时咨询：如果公司对某项法律法规或政策存在疑问或不确定，应及时咨询专业律师或相关部门，以确保公司的经营活动始终在法律框架内进行。
后续思考依据：
- 公司在经营过程中应始终关注法律法规的变化和更新，确保公司的经营活动始终符合最新的法律要求。
- 如果公司因为某种原因确实需要暂时或长期没有员工，也应确保公司的税务、社保等合规问题得到妥善处理，避免因此引发不必要的法律风险。
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