公司文员将公司财物或资金占为己有的行为，属于职务侵占或贪污（视公司性质而定）的违法行为，公司有权依法追究其法律责任，并可通过民事赔偿、行政处罚或刑事追责等方式处理。以下是具体分析：

1. 法律性质认定

   • 若公司为私营企业或民营企业，文员利用职务便利将公司财物非法占为己有，数额较大的（通常6万元以上），构成《刑法》第271条规定的职务侵占罪，可处3年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大的（通常100万元以上），可处3年以上10年以下有期徒刑，并处罚金。
     
   • 若公司为国有企业或国家控股企业，文员利用职务便利侵吞公共财物，数额较大的，构成《刑法》第382条规定的贪污罪，处罚更重，最高可处无期徒刑或死刑（仅限数额特别巨大且情节特别严重的情况）。
     
   • 若数额较小未达刑事标准，仍可能违反《治安管理处罚法》第49条，面临15日以下拘留及罚款；同时公司可依据《劳动合同法》第39条解除劳动合同，无需支付经济补偿。

2. 公司应对措施

   • 内部处理：立即暂停文员职务，封存相关账目、文件及电子数据（如电脑、手机），避免证据灭失；通过内部审计或委托第三方机构核查侵占金额及方式。
     
   • 民事追偿：向法院提起民事诉讼，要求文员返还侵占财物及赔偿损失（如利息、调查费用等）；若文员已离职，仍可主张权利。
     
   • 刑事报案：向公安机关经侦部门报案，提交侵占证据（如转账记录、签收单、证人证言等）；公安机关立案后，检察院将提起公诉，法院判决后公司可申请强制执行追缴赃款。
     
   • 行政举报：若涉及税务、工商等违规行为（如虚开发票套现），可向税务、市场监管部门举报，协同查处。

3. 预防与风险控制

   • 完善制度：建立财务审批分级制度，明确单笔资金支出权限；实行“双人经手”原则，避免单人操作关键环节。
     
   • 定期审计：委托会计师事务所进行年度审计，重点核查现金、存货等易侵占科目；对高风险岗位（如出纳、采购）实施轮岗制。
     
   • 员工培训：定期开展法律合规培训，明确侵占公司财物的法律后果；签订《廉洁承诺书》，强化员工责任意识。
     
   • 技术防控：安装财务软件操作日志监控系统，记录所有资金调拨记录；对重要文件设置访问权限，防止篡改或删除。

建议：若公司已发现文员侵占行为，应优先固定证据（如复印账目、截图聊天记录），再根据金额大小选择报案或民事诉讼；若金额较小，可先通过律师函警告要求返还，降低维权成本。如有具体案件细节（如金额、方式、公司性质等），可进一步向我咨询，我将协助制定针对性方案。