针对员工频繁请病假的情况，这确实是一个需要细致处理的问题，既要保障员工的合法权益，也要维护公司的正常运营秩序。以下是一些建议，希望能为您提供一些清晰的思路：
一、核实病假真实性
要求提供详细医疗证明：员工请病假时，应要求其提供详细的医疗证明，包括诊断书、病历、医疗费用发票等，以确认其病假的真实性。
定期跟进病情：对于长期病假的员工，公司可以定期与其联系，了解病情恢复情况，并要求其提供医疗机构的复查报告或医生建议。
二、审查病假合理性
对比医疗期规定：根据员工的工龄和司龄，确定其应享受的医疗期长度。如果员工请病假的时间超过了其应享受的医疗期，公司需要进一步审查其病假的合理性。
评估病情与工作能力：结合员工提交的医疗证明和病情恢复情况，评估其是否具备继续工作的能力。如果员工在病假期间能够从事其他活动（如考研、兼职等），但声称无法工作，这可能构成不诚信行为。
三、加强沟通与管理
与员工进行坦诚沟通：当发现员工频繁请病假或病假期间行为异常时，公司应与其进行坦诚沟通，了解其真实想法和需求，同时明确公司的期望和要求。
制定病假管理制度：公司可以制定明确的病假管理制度，规定病假的申请流程、审批程序、医疗证明要求等，以确保病假管理的规范性和公正性。
四、依法处理违纪行为
依据公司规章制度处理：如果员工的行为严重违反了公司规章制度或劳动纪律，公司可以依据相关规定对其进行处理，如警告、记过、解除劳动合同等。
寻求法律支持：在处理员工违纪行为时，公司应确保自己的行为符合法律法规要求。如果员工对公司的处理决定不服，公司可以寻求法律支持，通过劳动仲裁或诉讼等方式解决争议。
五、参考类似案例
如您所提供的案例中，S先生在病假期间隐瞒公司就读硕士研究生，并领取了高额薪酬。最终，法院认定其行为违反劳动纪律和诚实信用原则，须向公司返还超额薪酬。这一案例提醒我们，在处理员工病假问题时，应注重核实病假真实性、审查病假合理性，并加强沟通与管理，以避免类似情况的发生。
六、关注员工心理健康
同时，公司也应关注员工的心理健康状况，提供必要的心理支持和辅导。对于确实存在心理问题的员工，公司可以协助其寻求专业治疗，并为其提供适当的工作调整或休假安排。
综上所述，处理员工频繁请病假的问题需要综合考虑多个方面，包括核实病假真实性、审查病假合理性、加强沟通与管理、依法处理违纪行为以及关注员工心理健康等。希望这些建议能对您有所帮助。