店里扣你12天工资，这种做法是否合法，需要视具体情况而定。以下是我从不同角度为你进行的分析：
一、合法扣减工资的情形
法定扣减：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 举例：如果你因工作失误给店里造成了经济损失，且店里能证明这一点，同时劳动合同中有相关约定，那么店里可以按照上述规定扣减你的工资，但扣减额度有限制。
约定扣减：
- 如果劳动合同或店里规章制度中有明确规定，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么店里可以按照约定扣减你的工资。
- 举例：如果劳动合同中约定，员工旷工一天扣三天工资，且这种约定不违反法律法规，那么在你旷工的情况下，店里可以按照约定扣减工资。但需要注意的是，这种约定在实践中可能存在争议，因为过度扣减可能被视为对员工权益的侵害。
二、非法扣减工资的情形
无合法依据扣减：
- 如果店里没有合法依据，如没有劳动合同约定、没有规章制度规定，或者扣减的理由不成立（如以罚款为目的扣减工资），那么这种扣减就是非法的。
- 举例：店里仅仅因为你迟到了一次就扣减你12天工资，且没有劳动合同或规章制度作为依据，那么这种扣减就是非法的。
扣减额度超过法定限制：
- 即使店里有合法依据扣减工资，但如果扣减的额度超过了法定限制（如每月扣减超过工资的20%），那么超出部分也是非法的。
三、你的应对措施
与店里沟通：
- 首先，你可以尝试与店里沟通，了解扣减工资的具体原因和依据。如果店里的解释不合理或没有依据，你可以明确表达你的异议。
向劳动监察部门投诉：
- 如果与店里沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门会介入调查，并根据调查结果作出相应的处理。
申请劳动仲裁：
- 如果劳动监察部门的处理结果不能满足你的需求，你还可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁委员会会依法审理案件，并作出裁决。
总结与建议：店里扣你12天工资是否合法，需要视具体情况而定。如果店里有合法依据且扣减额度在法定范围内，那么这种扣减可能是合法的；否则，就是非法的。我建议你先与店里沟通了解情况，如果沟通无果再考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。