是的，预付甲方设备款时，甲方应当出具收据。这一行为不仅符合一般的商业惯例，也在法律上有相应的依据和要求。以下从多个角度进行详细分析：

1. 商业惯例角度：

   • 在商业交易中，当一方（如买方）向另一方（如卖方）预付款项时，接收款项的一方通常会出具收据作为证明。这是商业活动中普遍遵循的惯例，有助于确保交易的透明度和双方的权益。

2. 法律要求角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》中关于合同和债权债务的相关规定，虽然直接的法律条文可能并未明确规定预付设备款时必须出具收据，但收据作为证明交易发生和款项支付的重要凭证，在法律上具有证明力。
   • 在发生纠纷时，收据可以作为证据之一，帮助法院或仲裁机构查明事实，判断双方的权利义务关系。因此，从法律风险防范的角度来看，甲方出具收据是保护自身权益和避免潜在纠纷的重要措施。

3. 合同履行角度：

   • 如果双方已经签订了设备购买合同，并且合同中明确规定了预付款项的支付方式和时间，那么甲方在收到预付款后出具收据也是履行合同义务的一部分。这有助于确保合同的顺利执行和双方对合同履行情况的清晰了解。

4. 实际操作建议：

   • 在实际操作中，为了确保收据的有效性和合法性，建议收据上应明确载明付款人的名称、付款金额、付款时间、付款事由（如预付设备款）以及收款人的签名或盖章等信息。
   • 如果可能的话，双方还可以在合同中明确约定收据的出具方式和时间，以进一步规范交易流程。

可能遇到的特殊情况及建议：

• 如果甲方拒绝出具收据，买方可以要求甲方在转账时备注款项用途（如“预付设备款”），并保留好转账记录作为证据。同时，买方也可以考虑通过书面形式（如邮件、短信等）与甲方确认款项的支付和收据的出具事宜。
• 如果双方对收据的出具存在争议或无法达成一致意见，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取法律帮助和解决方案。

综上所述，预付甲方设备款时，甲方应当出具收据。这不仅符合商业惯例和法律要求，也是保护双方权益和避免潜在纠纷的重要措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。