劳务派遣员工怀孕期间请假工资的处理方式需根据请假类型和法律规定综合判断，具体如下：

1. 医疗期内的病假工资
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，怀孕女职工因妊娠反应、保胎等医疗原因请假的，属于医疗期范畴。此时工资支付需分两步判断：

   • 基础标准：医疗期内工资不得低于当地最低工资标准的80%（如《江苏省工资支付条例》第二十七条明确此标准）；
     
   • 特殊保护：若地方性法规对孕期女职工有更高保护（如上海规定医疗期工资按正常出勤工资的100%支付），则优先适用地方规定。
     关键点：需提供医院出具的病假证明，否则可能被认定为事假。

2. 产检假工资
   根据《女职工劳动保护特别规定》第六条，怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间，用人单位需按正常工资标准支付。例如：

   • 每次产检假设占用2小时，单位应支付该时段工资；
     
   • 若单位以“产检非工作时间”为由扣减工资，属于违法行为。

3. 保胎假工资
   若医生开具证明需保胎休息，此时工资支付分两种情形：

   • 医疗期保胎：按病假工资标准支付（最低工资80%）；
     
   • 非医疗期保胎：若单位批准为事假，则可不支付工资，但需注意：
     
     • 保胎假性质需由单位与员工协商确定；
       
     • 部分地区（如广东）明确保胎假按病假处理，单位不得单方面认定为事假。

4. 劳务派遣的特殊规则
   根据《劳务派遣暂行规定》第十条，被派遣劳动者患病或非因工负伤的，用工单位需将劳动者退回派遣单位，由派遣单位按医疗期规定支付工资。实务中需注意：

   • 派遣单位不得以“用工单位退回”为由拒绝支付医疗期工资；
     
   • 若用工单位直接扣减派遣员工工资，属于违法，派遣员工可同时向两单位主张权利。

操作建议：

1. 保留所有请假证明（病历、产检记录、医生建议书等）；
   
2. 核对劳动合同、派遣协议中关于病假/产检假的约定；
   
3. 若单位拒付工资，可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁；
   
4. 劳务派遣员工可同时要求派遣单位和用工单位承担连带责任。

如有具体案例细节（如请假类型、地区、单位态度等），可进一步向我说明，我会结合实际情况提供更精准的解决方案。