部门要求上交奖金的百分之五十作为业务费，这一做法是否合法，需分情况讨论：
若奖金属于员工工资总额的一部分：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。奖金作为工资的一种形式，同样受到法律保护。
- 如果部门要求上交的奖金部分实际上是对员工工资的克扣，且未经员工同意或未在劳动合同、规章制度中明确约定，那么这种做法是不合法的。员工有权拒绝，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
若奖金是作为额外奖励，且部门有明确规定或双方有约定：
- 如果奖金是公司为了激励员工而额外发放的，且部门在发放前已经明确告知员工奖金的一部分将作为业务费上交，或者双方在劳动合同、规章制度中有相关约定，那么这种做法可能是合法的。
- 但即便如此，部门也需要确保这种做法不违反法律法规的强制性规定，比如不得违反最低工资标准、不得侵犯员工的合法权益等。同时，部门应当确保约定的公平性和合理性，避免对员工造成不公平的负担。
从实际操作和合理性角度考虑：
- 即使部门有规定或双方有约定，如果上交比例过高（如本题中的百分之五十），也可能引发员工的反感和不满，进而影响工作积极性和团队凝聚力。
- 部门在制定相关规定或与员工进行约定时，应当充分考虑员工的利益和感受，确保规定的合理性和可行性。
法律建议：
- 如果你认为部门的要求不合法或不合理，可以先与部门进行沟通协商，表达你的意见和诉求。
- 如果沟通无果，你可以向公司的劳动争议调解委员会申请调解，或者向当地的劳动监察部门投诉。
- 你也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果部门的要求确实不合法，你通过法律途径维权后，部门可能需要退还你已上交的奖金部分，并可能面临劳动监察部门的处罚。
- 如果部门的要求合法但不合理，虽然你可能无法直接通过法律途径要求部门改变规定，但你的反馈和意见可能会促使部门重新审视和调整相关规定。
总之，部门要求上交奖金的百分之五十作为业务费是否合法，取决于奖金的性质、部门的规定或双方的约定以及法律法规的强制性规定。如果你对此有疑问或不满，建议及时咨询并寻求法律帮助。