侵犯商标权的管辖部门主要包括行政管理部门和司法部门，具体如下：

行政管理部门

1. 市场监督管理部门

   • 职能依据：根据《商标法》及相关规定，市场监督管理部门（原工商行政管理部门）是查处商标侵权行为的主要行政机构。
   • 管辖范围：一般由侵权行为的实施地、侵权商品的储藏地或者查封扣押地、被告住所地等地的市场监督管理部门管辖，具体为县级以上市场监督管理部门。
   • 具体职权：
     • 检查权：市场监督管理部门有权检查与侵权活动有关的物品，并查封或扣押有证据证明是侵权的物品。
     • 调查权：有权询问有关当事人，调查侵权情况，并查阅、复制相关合同、发票、账簿等资料。
   • 处理措施：认定侵权行为成立后，市场监督管理部门会责令立即停止侵权，没收并销毁侵权商品及制造工具。违法经营额超过5万元的，可处违法经营额5倍以下的罚款；不足5万元的，可处25万元以下的罚款。对重复侵权或有其他严重情节的，从重处罚。若销售者不知是侵权商品但能证明合法来源的，责令停止销售。

2. 海关部门

   • 职能依据：依据《知识产权海关保护条例》，海关负责保护进出口货物中涉及的商标专用权。
   • 具体职权：
     • 发现侵权嫌疑时，海关会立即通知知识产权权利人。
     • 经权利人申请并同意，海关会扣留侵权嫌疑货物，并通知权利人和收货人或发货人。
   • 处理措施：确认侵权后，海关会予以没收。没收后的货物可用于社会公益事业，或由权利人收购，或经消除侵权特征后拍卖（进口假冒商标货物除外），无法消除侵权特征的则予以销毁。

司法部门

1. 人民法院
   • 民事诉讼：商标注册人或利害关系人可向人民法院起诉，要求侵权人承担民事责任，包括停止侵害、赔偿损失等。赔偿数额可根据实际损失、侵权所得或商标许可使用费倍数确定，恶意侵权且情节严重的，赔偿数额可加倍。商标民事纠纷的第一审案件通常由中级以上人民法院及最高人民法院指定的基层人民法院管辖，具体包括侵权行为实施地、侵权商品储藏地、查封扣押地及被告住所地。
   • 刑事诉讼：对于情节严重的商标侵权行为，可能构成侵犯知识产权罪。此时，人民检察院会提起公诉，人民法院将依据犯罪情节对犯罪嫌疑人判处相应的刑罚，如有期徒刑、拘役、罚金等。

维权途径选择建议

• 初步处理：在遇到商标侵权行为时，建议首先向当地的市场监督管理部门进行举报或投诉，以便其及时展开调查与处理。
• 行政调解与查处：市场监督管理部门在接到投诉后，将依法进行查处，并根据当事人的请求就商标纠纷进行调解。若调解成功，双方应履行调解协议；若调解不成或调解书生效后不履行，当事人可进一步采取法律措施。
• 司法诉讼：若对市场监督管理部门的处理结果不满意，或希望通过法律途径直接解决纠纷，当事人可依法向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院将根据事实和法律规定作出公正裁决。

总结来说，侵犯商标权的管辖部门涉及多个层面，包括行政管理部门的市场监督管理部门和海关，以及司法部门的人民法院。商标权利人应根据具体情况选择合适的维权途径，并在整个过程中确保自身权益得到充分保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。