在遭遇商标侵权时，被侵权人可以向市场监督管理部门（即工商行政管理部门）投诉，或直接向人民法院提起民事诉讼，以追究侵权人的法律责任，并根据情况可能涉及公安部门的介入。以下是对此问题的详细解答：
一、市场监督管理部门（工商行政管理机关）的投诉与处理
投诉对象：
- 各级市场监督管理部门是负责商标管理工作的行政机关，县级以上工商行政管理机关均可接受投诉。
投诉后的处理流程：
- 市场监督管理部门有权对涉嫌商标侵权的行为进行查处，包括询问当事人、调查相关情况、查阅复制相关资料、实施现场检查等。
- 若侵权行为成立，市场监督管理部门将责令立即停止侵权行为，没收并销毁侵权商品及制造工具，并处以罚款；对于情节严重者，将从重处罚。
- 对于销售不知道是侵犯注册商标专用权的商品，但能证明合法取得并说明提供者的，将责令停止销售。
优势：
- 处理程序相对简便快捷，能及时制止侵权行为。
- 不收取费用，降低了维权成本。
二、人民法院的民事诉讼
起诉条件与管辖：
- 被侵权人可直接向人民法院提起商标侵权民事诉讼，要求侵权方承担停止侵权、消除影响、赔偿损失等民事责任。
- 起诉时需向有管辖权的法院提出，一般由侵权行为的实施地、侵权商品的储藏地或查封扣押地、被告住所地人民法院管辖。
诉讼优势：
- 通过司法程序全面追究侵权人的民事责任，赔偿数额确定等方面可能更有利于权利人。
- 法院判决具有更强的强制执行力，确保侵权人履行赔偿义务。
三、刑事责任的追究
- 在商标侵权情况特别严重，涉嫌犯罪时，可向公安部门报案，由公安部门立案侦查。
- 若侵权行为构成犯罪，侵权人除承担民事责任外，还可能面临刑事处罚，如有期徒刑、罚金等。
四、综合建议
根据侵权情况选择途径：
- 对于轻微的商标侵权行为，可以选择向市场监督管理部门投诉，以快速制止侵权行为并获取行政处罚。
- 对于严重的商标侵权行为，尤其是涉及经济损失较大的情况，建议直接向人民法院提起民事诉讼，以追求全面的民事赔偿和法律责任追究。
- 若侵权行为涉嫌犯罪，应及时向公安部门报案，以维护社会公共利益和自身合法权益。
及时采取措施保护权益：
- 无论选择哪种途径，都应及时采取措施保护自己的合法权益，避免损失扩大。例如，可以收集侵权证据、保留相关交易记录等，以便在投诉或诉讼过程中提供有力支持。
咨询专业律师：
- 在处理商标侵权纠纷时，由于涉及法律程序和专业知识较多，建议咨询专业律师的意见。作为专业律师，我可以根据您的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。