结论：公司福利体检查乙肝是否违法，需根据具体情况分析。一般情况下，未经员工同意进行乙肝检查可能侵犯隐私权，构成违规；但在特定行业如食品、药品、幼教等，因涉及公共卫生安全，相关法规可能要求乙肝检查，此时需确保检查合法、公正且结果保密。
详细分析：
一般情况下的规定：
- 根据劳动和社会保障部、卫生部2007年发布的《关于维护乙肝表面抗原携带者就业权利的意见》，以及后续的相关通知，用人单位在招、用工过程中，除国家法律、行政法规和卫生部规定禁止从事的工作外，不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准。
- 这意味着，在普通的入职体检或职业健康检查中，如果公司未经员工同意擅自检查乙肝相关项目，这通常是违规的，可能侵犯了员工的隐私权等相关权利。员工有权拒绝此类检查，并可以向相关部门投诉或寻求法律帮助。
特殊职业情况下的规定：
- 然而，对于某些特定职业，如食品生产经营、饮用水生产供应、公共场所服务、托幼机构保育等，由于这些职业直接涉及公共卫生安全，相关法律法规可能要求员工进行乙肝项目检测。
- 在这些特定职业的入职体检中，公司要求检查乙肝项目是符合规定的。但即便如此，公司也需确保检查过程的合法性、公正性，并严格保密检查结果，以保护员工的个人隐私权。如果公司未能做到这些，仍然可能构成违规。
公司应遵守的法律原则：
- 无论在哪种情况下，公司在进行乙肝检查时，都应充分尊重员工的权益，确保检查行为的合规性。
- 如需进行乙肝检查，公司应事先征得员工的明确同意，并告知检查的目的、范围以及结果的保密措施。这是保护员工隐私权的重要一环。
- 公司还应建立健全的隐私保护机制，确保员工的个人信息不被泄露或滥用。这不仅是法律的要求，也是公司应尽的社会责任。
建议与总结：
- 对于员工而言，如果公司未经同意要求进行乙肝检查，可以明确拒绝并了解自己的权利。如果公司坚持违规操作，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律帮助。
- 对于公司而言，应严格遵守相关法律法规，确保体检项目的合法性和合规性。在涉及乙肝检查时，应事先征得员工同意并告知相关事项，同时建立健全的隐私保护机制。
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