结论：停薪留职员工上班考核不合格被辞退是否有赔偿，需根据具体情况判断，主要包括用人单位是否合法辞退、是否协商一致解除劳动合同以及是否存在违法辞退等情形。

1. 用人单位合法辞退，无需支付赔偿

   • 劳动者存在过错：若停薪留职员工在上班后严重违反用人单位的规章制度，如多次旷工、营私舞弊给单位造成重大损害，或者因犯罪行为被依法追究刑事责任等，且这些行为符合《劳动合同法》第三十九条规定的情形，用人单位有权解除劳动合同且无需支付经济补偿。例如，员工利用职务之便泄露公司商业秘密，给公司造成重大经济损失，公司可以依法辞退且无需赔偿。
   • 法律依据：根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；（二）严重违反用人单位的规章制度的；（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；（六）被依法追究刑事责任的。

2. 协商一致解除劳动合同，需支付经济补偿

   • 协商解除：若用人单位与停薪留职员工双方协商一致解除劳动合同，根据《劳动合同法》第四十七条的规定，用人单位应向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。例如，员工在公司工作了5年，月工资为5000元，协商一致解除劳动合同后，公司应支付5个月工资作为经济补偿，即25000元。
   • 特殊规定：如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

3. 用人单位违法辞退，需支付赔偿金

   • 违法解除：如果用人单位没有法定理由，随意辞退停薪留职员工，则属于违法解除劳动合同。根据《劳动合同法》第八十七条的规定，用人单位应依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。例如，员工在公司工作了3年，月工资为6000元，若公司违法辞退，则需支付6个月工资作为赔偿金，即36000元。
   • 违法情形：包括未提前通知、未听取工会意见、未按照法定程序进行辞退等。

4. 其他特殊情况

   • 劳动合同期满：若停薪留职期间劳动合同期满，且用人单位决定不再续订劳动合同，用人单位应向劳动者支付经济补偿。但若用人单位维持或提高劳动合同约定条件续订劳动合同，而劳动者不同意续订的，则无需支付经济补偿。
   • 用人单位经营困难：若用人单位因生产经营发生严重困难等客观经济情况发生重大变化，导致劳动合同无法履行，且劳动者在停薪留职期间受到影响被辞退，用人单位应支付经济补偿。

建议：

• 对于停薪留职员工而言，应仔细审查自身情况与公司规定，了解自己的权益和义务。若被辞退，应要求公司出具书面辞退通知，并明确辞退原因。
• 对于用人单位而言，应严格遵守相关法律法规，确保辞退行为的合法性。在辞退员工前，应充分听取员工意见，并按照法定程序进行。
• 若双方对辞退行为存在争议，可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径解决。

总结：停薪留职员工上班考核不合格被辞退是否有赔偿，需根据具体情况判断。无论是用人单位还是劳动者，在解除劳动合同时都应遵循相关法律法规，确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。