关于您提出的“运输公司提档费是否合法”的问题，这并非一个直接由法律法规明确界定“合法”或“非法”的单一费用项目，而是需要结合具体情境和法律法规来综合分析。不过，我可以从相关法律法规和常见实践的角度，为您提供一些分析和建议。
首先，我们需要明确“提档费”的具体含义和背景。在运输行业中，“提档”通常指的是将车辆或相关档案从一个地区或部门转移到另一个地区或部门的过程。而“提档费”则可能是指在这一过程中产生的费用。然而，这个费用是否合法，主要取决于以下几个方面：
费用产生的依据：
- 如果提档费是基于当地交通运输管理部门或相关政府部门的明确规定或收费标准收取的，那么这种费用在法律上可能是合法的。
- 如果费用是运输公司自行设定，且没有明确的法律依据或政府批准，那么这种费用可能涉嫌违法。
费用的合理性和透明度：
- 即使提档费有法律依据，其金额也应当合理，且应当向车主或相关方明确说明费用的构成和计算方式。
- 如果费用过高或存在不透明的收费情况，可能引发争议，甚至被认定为不合法。
相关法律法规的遵守：
- 运输公司在收取提档费时，必须遵守《中华人民共和国道路运输条例》、《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规的规定。
- 如果运输公司存在未经许可擅自收费、超标准收费等违法行为，将可能面临行政处罚。
实际案例和执法实践：
- 从您提供的参考信息中，我们可以看到交通运输部门对非法营运行为的严厉打击，这体现了政府对运输市场秩序的维护。
- 虽然直接案例未涉及提档费，但类似案例表明，任何未经许可或违反规定的收费行为都可能受到法律的制裁。
建议：
- 如果您面临运输公司要求支付提档费的情况，首先要求运输公司提供明确的收费依据和标准。
- 如果对费用的合法性或合理性存在疑问，可以向当地交通运输管理部门或相关政府部门进行咨询或投诉。
- 在任何情况下，都应保留好相关证据，如收费通知、支付凭证等，以备不时之需。
综上所述，运输公司提档费的合法性取决于多个因素，包括费用产生的依据、合理性和透明度、相关法律法规的遵守等。如果您对具体费用有疑问，建议咨询专业法律人士或相关政府部门以获取更准确的解答。