结论：仲裁结束后，公司起诉并不影响你办理离职手续，但具体办理时间和方式需根据实际情况和法律规定来确定。
分析说明：
仲裁裁决的效力：
- 劳动仲裁裁决一旦作出，即具有法律效力。如果公司未在法定期限内提起诉讼，或者诉讼被驳回，仲裁裁决即生效，双方应按照裁决内容履行义务。
- 在这种情况下，你可以依据生效的仲裁裁决办理离职手续，公司应配合你完成相关流程。
公司起诉的影响：
- 如果公司在仲裁裁决后提起诉讼，这并不影响仲裁裁决的效力，但诉讼期间裁决的执行可能会受到一定影响，具体取决于法院是否裁定暂停执行。
- 然而，就离职手续而言，即使公司提起诉讼，你仍然有权要求公司按照法律规定或双方约定办理离职手续。公司不能以诉讼为由拒绝或拖延办理离职。
离职手续的办理：
- 离职手续通常包括工作交接、薪资结算、社保转移等。这些手续的办理应遵循公司规章制度和法律法规的规定。
- 你可以与公司协商确定离职手续的具体办理时间和方式。如果公司拒绝或拖延办理，你可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
法律后果：
- 如果公司未按照法律规定或双方约定办理离职手续，可能构成违法解除劳动合同或未依法支付经济补偿等违法行为。
- 在这种情况下，你有权要求公司承担相应的法律责任，包括支付赔偿金、继续履行劳动合同等。
行动建议：
- 与公司协商：首先尝试与公司协商确定离职手续的具体办理时间和方式，尽量达成一致意见。
- 保留证据：在协商过程中，注意保留相关证据，如聊天记录、邮件往来等，以备不时之需。
- 寻求法律援助：如果公司拒绝或拖延办理离职手续，或者存在其他违法行为，你可以及时寻求法律援助，维护自己的合法权益。
特殊场景：
- 如果仲裁裁决涉及公司支付你工资、经济补偿等款项，而公司未支付且提起诉讼，你可以在诉讼期间向法院申请财产保全，以确保裁决能够得到有效执行。
- 如果公司提起的诉讼涉及对仲裁裁决的撤销或变更，你需要密切关注诉讼进展，并根据法院判决结果采取相应的行动。
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