结论：学校代课老师怀孕且合同到期时，学校是否可以不续签合同不能一概而论，需分情况讨论。

1. 若原合同无特殊约定
   • 根据《劳动合同法》规定，劳动合同期满，劳动合同终止。一般情况下，学校作为用人单位在合同到期时，有权选择不续签合同。但是，对于怀孕的女职工，法律给予了特殊保护。
   • 《劳动合同法》第四十五条规定，劳动合同期满，有本法第四十二条规定情形之一的，劳动合同应当续延至相应的情形消失时终止。其中第四十二条第四项规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同，同时合同期满也不得终止，需顺延至孕期、产期、哺乳期结束。所以，如果原合同没有特殊约定，学校不能仅因合同到期就不续签，而应将合同顺延至“三期”结束。
2. 若原合同有特殊约定
   • 如果学校与代课老师在原合同中明确约定了合同到期不续签的相关条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么从合同自治原则来看，似乎学校可以依据合同约定不续签。
   • 然而，由于女职工处于孕期这一特殊生理时期，根据《妇女权益保障法》《劳动法》等相关法律对女职工特殊权益保护的精神，即使合同有约定，这种约定也可能因违反法律的强制性规定和公序良俗而被认定为无效。因为法律对孕期女职工的保护是强制性的，旨在保障女职工在特殊时期的合法权益，不允许用人单位通过合同约定来规避这种保护义务。所以，即便合同有特殊约定，学校通常也不能在老师怀孕且合同到期时不续签合同。

如果学校坚持不续签合同，代课老师可以通过与学校协商、向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。要是你还有其他关于劳动法律方面的问题，欢迎直接向我咨询。