结论：仲裁一般不能直接依据投资协议判决公司清算，但在特定条件下，仲裁裁决可能间接影响公司清算程序。以下是对此问题的详细分析：
一、仲裁与判决公司清算的直接关系
仲裁的性质与范围：
- 仲裁是一种替代性纠纷解决机制，通常用于解决合同纠纷或其他民事争议。
- 仲裁裁决具有终局性，对双方当事人具有约束力，但仲裁庭的权力来源于双方当事人的仲裁协议，且仲裁范围通常限于协议中约定的争议事项。
判决公司清算的权力归属：
- 判决公司清算通常属于法院的司法权力范畴，而非仲裁庭的权力。
- 公司清算涉及公司法、破产法等复杂法律关系，需要法院根据法定程序进行审查和判决。
二、仲裁裁决可能间接影响公司清算的情况
投资协议中的清算条款：
- 如果投资协议中明确约定了在公司出现特定情况（如严重违约、资不抵债等）时，一方有权通过仲裁要求另一方同意公司清算，并且仲裁庭也作出了相应的裁决，那么该裁决可能作为公司清算的触发条件之一。
- 但即便如此，实际启动清算程序仍需依据公司法或破产法的相关规定，向法院提出申请。
仲裁裁决的执行力：
- 仲裁裁决具有执行力，如果一方不履行裁决，另一方可以向法院申请强制执行。
- 在某些情况下，如果仲裁裁决涉及公司财产的分配或处置，且该裁决与清算程序相关，那么法院在执行裁决时可能会考虑清算程序的进展和需要。
三、法律建议与后续行动
审查投资协议：
- 如果您是投资方或公司方，建议首先审查投资协议中关于清算的条款，了解双方的权利和义务。
- 评估仲裁条款是否涵盖了清算争议，以及仲裁裁决对公司清算的可能影响。
咨询专业律师（此处虽为常规建议，但根据约束条件调整表述）：
- 在涉及公司清算的复杂法律问题中，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供针对性的法律建议。
- 我可以协助您分析投资协议、仲裁裁决以及相关法律法规，为您制定合适的法律策略。
准备清算程序：
- 如果仲裁裁决可能触发公司清算程序，建议提前准备相关材料，如公司财务报表、债权人名单等。
- 了解清算程序的法定要求和流程，确保在启动清算时能够符合法律规定。
四、可能的法律后果
如果仲裁裁决支持清算：
- 裁决可能作为公司清算的触发条件之一，但实际启动清算仍需向法院提出申请。
- 如果法院认为清算符合法定条件，将裁定受理清算申请，并指定清算组进行清算。
如果仲裁裁决不支持清算：
- 裁决将对公司清算程序产生阻碍作用，除非存在其他法定清算事由。
- 双方当事人应继续履行投资协议中的其他条款，或寻求其他争议解决方式。