在承包的耕地被征收的情况下，征收协议的主体通常是征收方（如政府或其指定的部门）与被征收方（即耕地的承包方或实际使用人）。以下是对此问题的详细分析：

1. 征收方：

   • 征收方通常是政府或其指定的部门，如国土资源部门、住房和城乡建设部门等。这些部门根据国家的土地征收政策和相关法律法规，负责实施土地征收工作。
   • 征收方在征收协议中作为甲方，负责提出征收方案、支付征收补偿费用、办理相关手续等。

2. 被征收方：

   • 被征收方是耕地的承包方或实际使用人。在承包的耕地被征收的情况下，承包方作为土地的使用权人，有权与征收方签订征收协议，并获得相应的补偿。
   • 如果承包方已经将耕地转包或出租给他人使用，那么在实际操作中，可能需要与转包方或承租方协商，确定谁作为被征收方与征收方签订协议。但通常情况下，承包方作为土地的使用权人，仍然是征收协议的主要签订方。

3. 协议内容：

   • 征收协议应明确双方的权利和义务，包括征收土地的范围、补偿标准、支付方式、搬迁期限等。
   • 协议还应规定违约责任和争议解决方式，以确保双方在协议履行过程中的权益得到保障。

4. 法律建议：

   • 在签订征收协议前，承包方应仔细了解征收政策和相关法律法规，确保自己的权益得到充分保障。
   • 如果对征收协议的内容有疑问或不满，承包方有权与征收方进行协商，或寻求法律援助以维护自己的合法权益。
   • 在签订协议时，承包方应确保协议内容明确、具体，避免出现模糊或歧义的条款，以免在后续履行过程中产生纠纷。

5. 可能后果：

   • 如果承包方未与征收方签订征收协议，而征收方强行征收土地，承包方有权向相关部门投诉或提起法律诉讼，要求征收方承担相应的法律责任。
   • 如果承包方在签订协议后未按照协议约定履行义务，如拒绝搬迁或未按时领取补偿费用等，征收方有权根据协议约定采取相应的法律措施。

总结来说，承包的耕地被征收时，征收协议的主体是征收方与被征收方（即耕地的承包方或实际使用人）。在签订协议前，承包方应充分了解征收政策和相关法律法规，确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或不满，应及时与征收方协商或寻求法律援助。