劳务合同确实能够依据工资支付条例进行处理，但当农民工工资行政处理与民事判决出现矛盾时，需要具体分析并寻求合适的解决方案。

1. 劳务合同与工资支付条例的关系：

   • 劳务合同是双方约定提供劳务并支付报酬的协议，其中应明确劳务的内容、报酬标准、支付方式及时间等。
   • 工资支付条例是为了保障劳动者（包括农民工）的合法权益，规范工资支付行为而制定的行政法规。
   • 在劳务合同中，如果双方约定了遵守工资支付条例的相关规定，那么当发生工资支付争议时，可以依据该条例进行处理。

2. 农民工工资行政处理与民事判决的矛盾：

   • 农民工工资行政处理通常是由劳动行政部门对拖欠农民工工资的行为进行查处，并作出相应的行政决定，如责令支付工资、罚款等。
   • 民事判决则是通过司法程序，由法院对涉及农民工工资的民事纠纷进行审理，并作出具有法律效力的判决。
   • 当两者出现矛盾时，可能的原因包括事实认定不同、法律依据不同或处理程序上的冲突等。

3. 解决方案：

   • 优先协商：首先，双方应尝试通过协商的方式解决矛盾，明确各自的权益和义务，寻求双方都能接受的解决方案。
   • 行政复议或诉讼：如果协商无果，对于行政处理决定不服的，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，由复议机关或法院对行政处理决定的合法性进行审查。
   • 执行程序协调：在民事判决和行政处理决定都需执行的情况下，应协调好两者的执行程序，避免执行冲突。如民事判决已确定支付义务，而行政处理决定又要求支付相同或类似的款项，应确保执行过程中不重复支付或遗漏支付。
   • 寻求专业法律意见：在处理此类复杂矛盾时，建议咨询专业律师，获取针对性的法律意见和指导，以确保自身权益得到有效维护。

总之，劳务合同可以依据工资支付条例进行处理，但当农民工工资行政处理与民事判决出现矛盾时，应综合考虑各种因素，寻求合适的解决方案。如有需要，请随时向我咨询。