农民工工资的判决依据主要取决于劳动合同，而非农务合同。以下是具体分析：

1. 劳动合同是核心依据
   根据《中华人民共和国劳动合同法》及《保障农民工工资支付条例》，农民工与用人单位建立劳动关系时，应签订书面劳动合同。劳动合同中明确约定的工资标准、支付方式、支付时间等内容，是法院或仲裁机构判决工资争议的主要依据。若用人单位未签订书面合同，但存在事实劳动关系（如通过考勤记录、工资发放记录等证明），法院仍会参照同工同酬原则或行业标准判决工资。

2. 农务合同的适用场景有限
   农务合同通常指农民与承包方（如农业合作社、种植大户）就土地承包、农产品种植等事项签订的协议。若农民工受雇于此类主体，但工作内容属于农业生产经营（如种植、收割），且双方约定按工作量或产值结算报酬，则可能适用农务合同。但需注意：

   • 若农务合同实质为劳务合同（如短期雇佣），则可能适用《民法典》中关于劳务合同的规定；
     
   • 若农民工与用人单位符合劳动关系特征（如长期固定工作、接受管理），即使签订“农务合同”，仍可能被认定为劳动合同，按劳动法处理。

3. 关键区分点
   法院判决时会重点审查：

   • 劳动关系特征：是否存在人身依附性（如考勤、奖惩）、经济从属性（如工资定期发放）；
     
   • 合同性质：合同条款是否符合劳动法要求（如社会保险、休息休假）；
     
   • 实际履行情况：工资发放记录、工作证、同事证言等证据。

建议：若您遇到工资争议，需优先收集劳动合同、工资条、考勤记录等证据；若未签订合同，可提供工作证、工作服、微信聊天记录等证明劳动关系。如有疑问，可直接向我咨询具体案件处理方案。