结论：公司以加班没有打卡为由不计算工资是不合法的。面对这种情况，你可以通过收集证据、与公司沟通、申请调解或投诉、申请劳动仲裁以及提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。

详细分析与建议：

1. 公司行为的合法性分析：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位安排劳动者加班的，应当按照国家有关规定支付加班费。打卡只是记录工作时间的一种方式，但并非唯一方式。如果公司仅以没有打卡为由拒绝支付加班费，这是不合法的。

2. 收集证据：

   • 考勤记录：尽管没有打卡，但你可以尝试从公司考勤系统导出加班记录（如果有的话），或者自行记录加班时间，并请同事或上级确认。
   • 工作成果及沟通记录：保存加班期间的工作产出，如报告、邮件、聊天记录等，以及与上级或同事关于加班的沟通记录，这些都能证明你加班的事实。
   • 同事证言：如果有同事也参与了加班，可以请求他们出具书面证言，证明你加班的情况。

3. 与公司沟通：

   • 首先，尝试与上级或人力资源部门友好沟通，说明你加班但未打卡的情况，并提供上述证据，寻求公司支付加班费。
   • 如果口头沟通无效，可以通过电子邮件等正式方式再次提出诉求，并设定合理的回复期限。

4. 申请调解或投诉：

   • 如果与公司沟通无果，你可以向当地劳动调解委员会申请调解，寻求和解。
   • 同时，你也可以向劳动监察部门投诉，提交相关证据材料，并跟进处理进度。劳动监察部门有权对公司进行调查，并要求公司支付加班费。

5. 申请劳动仲裁：

   • 如果调解和投诉均未能解决问题，你可以向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，明确仲裁请求（如要求公司支付加班费）并附上证据。
   • 参加仲裁庭审时，要陈述事实、出示证据，并进行质证和辩论。仲裁庭将作出具有法律效力的裁决，双方必须遵守。

6. 提起诉讼：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，如果你对仲裁结果不满，可以向法院提起诉讼。
   • 诉讼过程中，你需要提交相关证据，并遵循法院的诉讼程序。法院将作出最终判决，判决结果具有强制执行力。

注意事项：

• 在整个维权过程中，务必保持冷静和理智，依据法律法规和事实主张权益。
• 保留好所有相关证据，这是维权成功的关键。证据应尽可能完整、真实、有效。
• 了解并遵循法律程序，确保每一步都合法合规。如果你对法律程序不熟悉，可以寻求专业法律人士的帮助（当然，你可以直接向我咨询）。

面对公司以加班没有打卡为由不计算工资的情况，你有多种途径可以维护自己的合法权益。希望以上分析和建议能对你有所帮助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。