结论：建立农业合作社占用村委空置房是否违法，需根据房屋性质、占用程序及用途等具体情况综合判断，可能存在合法与违法两种情形。具体分析如下：

1. 若房屋产权归属村委且占用程序合法，则可能不违法
   根据《民法典》第二百六十六条，村委作为集体经济组织，对其名下的财产（包括空置房）享有占有、使用、收益和处分的权利。若农业合作社与村委通过合法程序（如村民会议或村民代表会议表决通过）签订房屋使用协议，明确约定使用期限、用途及补偿方式，且房屋用途符合农业合作社的设立目的（如办公、仓储等），则占用行为具有合法性。此外，若房屋属于闲置校舍、仓库等集体资产，根据《乡村振兴促进法》第五十二条，鼓励通过租赁、入股等方式盘活利用，此类占用行为亦受法律保护。

2. 若房屋产权存在争议或占用程序违法，则可能构成侵权或违法
   若房屋实际产权归属村民个人（如因历史遗留问题未明确权属），或村委未经法定程序擅自将房屋提供给合作社使用，则可能侵犯房屋所有权人的合法权益。根据《民法典》第二百三十五条，所有权人有权要求返还房屋；若占用行为导致房屋损坏，还需承担赔偿责任。此外，若合作社将房屋用于非农业用途（如商业经营、住宅等），则违反《土地管理法》第六十三条关于集体建设用地用途管制的规定，可能面临行政处罚（如责令限期改正、没收违法所得）甚至刑事责任（如构成非法转让、倒卖土地使用权罪）。

3. 特殊情形：房屋属于公益设施或受法律保护
   若空置房属于村卫生室、文化活动室等公益设施，根据《村民委员会组织法》第三十八条，其用途变更需经村民会议讨论决定并报乡镇政府批准。未经批准擅自占用，可能因违反法定程序而被认定违法。此外，若房屋属于历史建筑或文物保护单位，占用行为还需遵守《文物保护法》等相关规定，否则可能承担行政责任或刑事责任。

建议：

• 合作社应首先核实房屋产权归属，通过查询不动产登记簿或咨询乡镇政府确认权属；
  
• 占用前需履行民主议定程序（如召开村民会议表决），并与村委签订书面使用协议；
  
• 确保房屋用途符合农业合作社的设立目的及土地管理法规，避免擅自改变用途；
  
• 若涉及公益设施或受保护建筑，需提前办理审批手续。
  

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