结论：劳务发票要求包含总包代发的农民工工资部分，是否合理需分情况讨论，具体如下：

1. 若总包单位与劳务公司存在合法有效的分包/转包合同，且合同明确约定“总包代发工资属于劳务公司应得工程款的一部分”
   此时劳务公司开具的发票金额应包含代发工资部分。因为根据《保障农民工工资支付条例》第三十一条，分包单位（劳务公司）需委托总包单位代发工资，但代发工资本质是劳务公司应支付给农民工的劳动报酬，属于劳务公司向总包单位提供劳务的“对价”组成部分。
   法律依据：

   • 《发票管理办法》第十九条：销售商品、提供服务的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，应向付款方开具发票；
     
   • 《民法典》第五百零九条：当事人应按约定全面履行义务。若合同明确约定代发工资属于劳务款范围，劳务公司必须将该部分纳入发票金额。
     操作建议：总包单位应要求劳务公司在合同中明确“代发工资计入劳务结算总额”，并附农民工工资表作为发票附件，避免后续争议。

2. 若总包单位与劳务公司未明确约定代发工资的性质，或劳务公司主张“代发工资是总包单位额外承担的责任”
   此时劳务公司可能拒绝将代发工资纳入发票金额，但这种做法存在法律风险。根据《保障农民工工资支付条例》第三十一条，分包单位（劳务公司）是农民工工资的支付主体，总包单位代发仅是“代为履行”行为，不改变工资的支付责任归属。
   风险点：

   • 劳务公司若不开具包含代发工资的发票，可能被税务机关认定为“少计收入”，面临补税、罚款风险（《税收征收管理法》第六十三条）；
     
   • 总包单位若未取得足额发票，其支付的代发工资可能无法作为工程成本税前扣除（《企业所得税法》第八条）。
     解决路径：双方应补充签订协议，明确“代发工资属于劳务公司应得工程款的一部分”，并由劳务公司补开发票。

3. 特殊情形：总包单位与劳务公司约定“代发工资与劳务款独立结算”
   若双方明确约定“代发工资由总包单位另行支付，不计入劳务公司工程款”，则劳务公司开具的发票可不包含该部分。但需满足以下条件：

   • 合同中明确区分“劳务款”与“代发工资”；
     
   • 农民工工资表由劳务公司签字确认，证明工资支付责任仍归劳务公司；
     
   • 总包单位实际支付代发工资时，备注“代付劳务公司农民工工资”等字样，避免资金混同。
     风险提示：此种模式下，总包单位需确保代发工资的资金来源独立，否则可能被认定为“未足额支付工程款”，引发劳务公司索赔。

总结建议：

• 对总包单位：要求劳务公司将代发工资纳入发票金额，并在合同中明确约定，同时留存工资表、委托代发协议等证据；
  
• 对劳务公司：若合同未约定，应主动与总包单位协商补开包含代发工资的发票，避免税务风险。
  

如有进一步争议（如合同条款模糊、双方对代发工资性质分歧），可提供具体合同文本，我将结合条款细节分析责任归属。