在工厂中，签订以下协议通常是不违法的，但关键在于协议内容需合法合规，且不得违反法律法规的强制性规定：

1. 劳动合同：

   • 合法性：劳动合同是工厂与员工之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，建立劳动关系应当订立书面劳动合同。
   • 内容要求：劳动合同应包含劳动合同期限、工作内容和工作地点、工作时间和休息休假、劳动报酬、社会保险、劳动保护、劳动条件和职业危害防护等必备条款。
   • 注意事项：劳动合同的内容不得违反法律法规的强制性规定，如不得约定试用期超过法定时限、不得约定低于最低工资标准的劳动报酬等。

2. 保密协议：

   • 合法性：保密协议是工厂与员工之间就商业秘密、技术秘密等敏感信息的保密义务所达成的协议。在符合法律法规的前提下，保密协议是合法的。
   • 内容要求：保密协议应明确保密信息的范围、保密期限、保密义务及违约责任等。
   • 注意事项：保密协议不得限制员工的合法就业权利，如不得约定员工在离职后一定期限内不得从事同类工作等不合理条款。

3. 竞业限制协议：

   • 合法性：竞业限制协议是工厂与高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员之间，就离职后一定期限内不得在生产同类产品、经营同类业务或有其他竞争关系的用人单位任职所达成的协议。在符合法律法规的前提下，竞业限制协议是合法的。
   • 内容要求：竞业限制协议应明确竞业限制的范围、地域、期限、经济补偿及违约责任等。
   • 注意事项：竞业限制期限不得超过二年，且工厂需向员工支付合理的经济补偿。

4. 培训服务期协议：

   • 合法性：当工厂为员工提供专项培训费用，对其进行专业技术培训时，可以与员工订立协议，约定服务期。在符合法律法规的前提下，培训服务期协议是合法的。
   • 内容要求：培训服务期协议应明确培训内容、培训费用、服务期期限及违约责任等。
   • 注意事项：员工违反服务期约定的，应当按照约定向工厂支付违约金，但违约金的数额不得超过工厂提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。

在签订协议时，工厂和员工都应注意以下几点：

• 协议内容合法合规：确保协议内容不违反法律法规的强制性规定，不侵犯员工的合法权益。
• 明确双方权利义务：协议应明确双方的权利和义务，避免模糊不清或产生歧义。
• 协商一致：协议的签订应基于双方协商一致的原则，不得强迫或欺诈员工签订协议。
• 保留证据：在签订协议时，双方应保留好相关证据，如协议文本、签字确认等，以备不时之需。

若工厂或员工对协议内容有疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。作为专业律师，我擅长处理工伤赔偿、离婚、合同纠纷、房产纠纷、交通事故、刑事辩护等领域的问题，如果你有任何法律问题，都可以直接向我咨询。