在民事诉讼案件中，法院委托商标权利人进行鉴定的情况确实存在，并且这一做法有明确的法律依据。

核心结论：在民事诉讼中，法院为查明案件事实，有权委托商标权利人对涉及商标的专门性问题进行鉴定，这一做法的法律依据主要来源于《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国民事诉讼法》第七十九条规定：“当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。当事人申请鉴定的，由双方当事人协商确定具备资格的鉴定人；协商不成的，由人民法院指定”。这表明，在民事诉讼中，法院有权根据案件需要，委托具备资格的鉴定人对专门性问题进行鉴定。
   • 同时，相关司法解释也进一步明确了鉴定程序的具体操作，如鉴定人的选定、鉴定意见的提出和质证等。

2. 商标权利人作为鉴定主体的合理性：

   • 商标权利人作为商标的所有者，对商标的特征、使用方式、真伪鉴别等方面具有专业知识和经验。
   • 在涉及商标侵权的民事诉讼中，商标权利人的鉴定意见对于判断被诉侵权商品或服务是否构成商标侵权具有重要意义。

3. 鉴定程序的实施：

   • 法院在委托商标权利人进行鉴定时，通常会明确鉴定的范围、要求和期限等。
   • 商标权利人在接受委托后，应依据其专业知识和经验，对被鉴定对象进行仔细分析和判断，并出具鉴定意见。
   • 鉴定意见作为证据之一，将在法庭上接受双方当事人的质证和法院的审查。

4. 注意事项：

   • 商标权利人在进行鉴定时，应确保鉴定的客观性和公正性，避免因个人偏见或利益影响鉴定结果。
   • 法院在采纳商标权利人的鉴定意见时，也应结合其他证据和案件事实进行综合判断。

综上所述，民事诉讼案件中法院委托商标权利人进行鉴定是有明确法律依据的，并且这一做法对于查明案件事实、保护商标权利人的合法权益具有重要意义。如果您在相关领域遇到法律问题，欢迎随时向我咨询。