非法出版物的主管部门主要涉及新闻出版行政部门，同时公安部门以及文化市场综合执法机构也依据各自职责参与相关工作。具体来说：

1. 新闻出版行政部门的主导作用：

   • 新闻出版署或省级新闻出版局是负责非法出版物认定的主要行政机关。它们负责通令取缔盗用出版单位名义或未经批准擅自出版的非法出版物，并处理相关事宜。
   • 当出版单位或其他有关单位、个人请求认定非法出版物时，需向新闻出版行政部门提交出版物样本及相关证据材料，以便进行准确识别。

2. 公安部门的参与：

   • 在涉及出版物的刑事案件中，公安部门有权对涉嫌构成犯罪的非法出版物进行性质认定，并依法进行查处。
   • 特别是当非法出版物与传播淫秽物品、宣扬恐怖主义等刑事犯罪相关联时，公安部门将发挥重要作用。

3. 文化市场综合执法机构的日常监管：

   • 文化市场综合执法机构负责文化市场中非法出版物的日常检查、认定和查处工作。
   • 它们通过日常巡查、专项行动等方式，确保市场中的出版物合法合规，维护出版市场的秩序。

综上所述，非法出版物的主管部门是一个多部门协同工作的体系，其中新闻出版行政部门起主导作用，公安部门和文化市场综合执法机构则根据各自职责进行配合。如果您在出版或文化市场方面遇到任何问题，特别是涉及非法出版物的问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助和建议。