结论前置：生病请假单位扣钱是否合法，需根据具体情况判断，一般情况下，若符合法定病假规定，单位扣钱可能不合法；若不符合规定或存在其他特殊情况，单位扣钱可能有其合理性。以下从不同角度详细分析：
一、法定病假与工资支付规定
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及《劳动法》的相关规定，员工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，企业应根据员工本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期。在医疗期内，员工有权享受病假工资或疾病救济费，且病假工资或疾病救济费不得低于当地最低工资标准的80%。
具体分析：
医疗期内的工资支付：若员工处于医疗期内，且已按照单位规定提交了病假证明等相关材料，单位应按照法律规定支付病假工资或疾病救济费。此时，单位扣钱可能违反法律规定。
医疗期外的处理：若员工医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以解除劳动合同，但需按照法律规定支付经济补偿金。在医疗期满前，若员工未按照单位规定提交病假证明或未经批准擅自离岗，单位可能根据规章制度进行扣钱等处理，但需确保规章制度合法且已告知员工。
二、单位规章制度与劳动合同约定
除了法定规定外，单位规章制度和劳动合同中也可能对病假工资支付、请假流程等作出具体规定。
具体分析：
规章制度合法性：若单位规章制度中明确规定了病假工资的支付标准、请假流程等，且该规章制度已依法制定并告知员工，员工应遵守。但规章制度不得违反法律法规的强制性规定，否则无效。
劳动合同约定：若劳动合同中明确约定了病假工资的支付方式、标准等，双方应按照劳动合同约定执行。但劳动合同约定不得低于法定最低标准。
三、特殊情况下的处理
在某些特殊情况下，如员工存在严重违反单位规章制度的行为、旷工等，单位可能根据规章制度进行扣钱等处理。
具体分析：
严重违反规章制度：若员工因生病请假但未按照单位规定提交病假证明、未经批准擅自离岗等，且情节严重，单位可能根据规章制度进行扣钱、警告、解除劳动合同等处理。但需确保规章制度合法且已告知员工，且处理措施与违规行为相适应。
旷工处理：若员工未请假或请假未获批准而擅自离岗，构成旷工的，单位可根据规章制度进行扣钱等处理。但需注意，旷工处理需符合法律法规和规章制度的规定，且应确保员工的合法权益不受侵害。
四、建议与行动
核实单位规定：首先，建议您核实单位的规章制度和劳动合同中关于病假工资支付、请假流程等的规定，确保自己的权益不受侵害。
与单位沟通：若您认为单位扣钱不合法或不合理，可与单位进行沟通协商，要求单位说明扣钱理由并提供相关依据。
寻求法律援助：若沟通无果或单位行为明显违法，您可向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
最后，生病请假是员工的合法权益，单位应依法支付病假工资或疾病救济费。若您遇到单位扣钱等不合理情况，请及时采取措施维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。