结论：单位利用生育津贴减去产假期间的五险一金的做法是否合法，需分情况讨论，若生育津贴的发放标准本身就已扣除了五险一金个人缴纳部分，则单位做法不合法；若生育津贴未扣除五险一金个人缴纳部分，单位在发放生育津贴时扣除该部分费用，则单位做法合法。以下为详细分析：

一、生育津贴的发放标准与性质

生育津贴是国家法律、法规规定对职业妇女因生育而离开工作岗位期间，给予的生活费用。其发放标准通常与女职工的产假天数和生育或流产前12个月的平均缴费工资有关。根据《女职工劳动保护特别规定》第八条，生育津贴的发放标准为：女职工产假期间的生育津贴，对已经参加生育保险的，按照用人单位上年度职工月平均工资的标准由生育保险基金支付；对未参加生育保险的，按照女职工产假前工资的标准由用人单位支付。

生育津贴的性质是女职工因生育而暂时中断劳动时，由社会保险机构或用人单位提供的经济补偿，旨在保障女职工在产假期间的基本生活需要。

二、五险一金的缴纳与扣除

五险一金包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险和住房公积金。根据相关法律法规，用人单位和职工应当按照规定比例共同缴纳五险一金。其中，生育保险由用人单位缴纳，职工个人不缴纳生育保险费。

在产假期间，女职工虽然暂时中断劳动，但其与用人单位的劳动关系仍然存在，因此五险一金的缴纳义务并未免除。然而，由于生育保险由用人单位缴纳，且生育津贴的发放与生育保险相关，因此产假期间五险一金的缴纳与生育津贴的发放之间存在一定的关联。

三、单位做法的合法性分析

1. 若生育津贴的发放标准本身就已扣除了五险一金个人缴纳部分：

   • 在这种情况下，生育津贴的发放金额已经考虑了五险一金的缴纳因素，因此单位再从生育津贴中扣除五险一金个人缴纳部分是不合法的。因为这相当于对女职工进行了双重扣除，损害了女职工的合法权益。

2. 若生育津贴未扣除五险一金个人缴纳部分：

   • 在这种情况下，单位在发放生育津贴时扣除五险一金个人缴纳部分是合法的。因为五险一金的缴纳是女职工和用人单位的共同义务，即使女职工在产假期间，这一义务仍然存在。单位在发放生育津贴时扣除五险一金个人缴纳部分，可以视为是对女职工应缴纳部分的代扣代缴，符合相关法律法规的规定。但需要注意的是，单位扣除的部分应仅限于女职工个人应缴纳的部分，不应包括用人单位应缴纳的部分。

四、建议与注意事项

1. 女职工应了解自己的生育津贴发放标准和五险一金缴纳情况：

   • 女职工在产假前应向用人单位或社会保险机构了解自己的生育津贴发放标准和五险一金缴纳情况，以便在产假期间维护自己的合法权益。

2. 单位应依法发放生育津贴和缴纳五险一金：

   • 单位应严格按照相关法律法规的规定发放生育津贴和缴纳五险一金，不得损害女职工的合法权益。如单位存在违法行为，女职工可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

3. 双方应加强沟通与协商：

   • 在产假期间，女职工和单位应加强沟通与协商，共同解决可能出现的争议和问题。如双方无法达成一致意见，可以寻求第三方调解或仲裁机构的帮助。

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