结论概述：针对员工监守自盗且工厂有把柄在其手上的情况，工厂应首先确保自身行为的合法性，同时积极收集证据，通过法律途径解决员工监守自盗的问题，并妥善处理与员工之间的纠纷，以避免潜在的法律风险。

一、工厂应确保自身行为的合法性

工厂在处理此类问题时，必须确保自身行为的合法性，避免采取非法手段（如非法拘禁、威胁、恐吓等）来获取证据或迫使员工就范。这些行为不仅可能违反法律法规，还可能引发更严重的法律后果，如刑事责任或民事赔偿。

二、积极收集证据，通过法律途径解决员工监守自盗问题

1. 证据收集：工厂应积极收集员工监守自盗的证据，包括但不限于监控录像、物品缺失记录、员工行为记录等。这些证据将有助于工厂在后续的法律程序中证明员工的违法行为。
2. 报警处理：在收集到足够证据后，工厂应及时向公安机关报案，由公安机关依法对员工进行调查和处理。如果员工的监守自盗行为构成犯罪，将依法追究其刑事责任。
3. 民事赔偿：除了刑事责任外，工厂还可以根据《民法典》的相关规定，要求员工承担民事赔偿责任。工厂可以向法院提起民事诉讼，要求员工赔偿因监守自盗行为给工厂造成的损失。

三、妥善处理与员工之间的纠纷，避免潜在法律风险

1. 协商解决：在处理此类纠纷时，工厂可以尝试与员工进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。协商解决可以节省时间和成本，同时也有助于维护工厂与员工之间的关系。
2. 法律途径：如果协商无果，工厂应通过法律途径解决纠纷。工厂可以聘请专业律师，准备相关证据材料，向法院提起诉讼或申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，工厂应积极配合律师的工作，提供必要的协助和支持。
3. 注意“把柄”问题：对于工厂所担忧的“把柄”问题，工厂应首先评估这些“把柄”的真实性和合法性。如果“把柄”涉及工厂的违法行为或不当行为，工厂应立即停止相关行为，并采取措施进行纠正。同时，工厂也可以考虑与员工进行沟通，解释相关情况，以消除员工的顾虑和误解。如果“把柄”并不构成法律上的威胁或影响，工厂则无需过分担忧，但应确保在处理纠纷过程中不泄露或滥用这些信息。

四、预防措施与建议

1. 加强内部管理：工厂应加强内部管理，完善相关制度和流程，确保员工的行为受到有效监督和约束。例如，可以建立严格的物品出入库制度、加强监控设备的安装和维护等。
2. 提高员工法律意识：工厂可以通过培训、宣传等方式提高员工的法律意识，让员工了解监守自盗等违法行为的严重后果和法律责任。这有助于减少员工违法行为的发生。
3. 建立纠纷解决机制：工厂可以建立纠纷解决机制，如设立内部调解委员会或聘请外部调解机构等，以便在发生纠纷时能够及时、有效地进行解决。

在处理此类问题时，工厂应保持冷静和理性，避免采取过激或非法的行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。