若已签订薪资协议但公司仅发放基本工资，劳动者有权要求公司按协议约定补发差额部分工资，若公司拒绝可依法维权。以下从多个角度进行分析：

法律层面

1. 薪资协议的效力 薪资协议是劳动者与用人单位就工资待遇等事项达成的合意，只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不存在欺诈、胁迫等导致合同无效或可撤销的情形，该协议对双方均具有法律约束力。用人单位应当按照协议约定向劳动者支付工资，不得擅自变更或减少。
2. 用人单位的违约责任 如果用人单位仅发放基本工资，未按照薪资协议约定支付其他部分工资，如绩效工资、奖金等，属于违约行为。劳动者有权要求用人单位按照协议约定补发差额部分工资。若用人单位拒绝补发，劳动者可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条“未及时足额支付劳动报酬的”规定，解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
3. 举证责任 在维权过程中，劳动者需要承担一定的举证责任，以证明用人单位未按照薪资协议约定支付工资。劳动者可以收集以下证据：薪资协议原件或复印件、工资条、银行流水记录、与用人单位沟通工资问题的聊天记录或录音等。这些证据可以证明劳动者与用人单位之间存在薪资协议以及用人单位未按照协议约定支付工资的事实。

维权途径

1. 与用人单位协商 劳动者可以先与用人单位进行友好协商，明确指出用人单位未按照薪资协议约定支付工资的行为已经构成违约，要求用人单位按照协议约定补发差额部分工资。在协商过程中，劳动者可以提供相关证据，以支持自己的主张。如果用人单位认识到自己的错误，愿意补发工资，那么问题可以得到妥善解决。
2. 向劳动监察部门投诉 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位的劳动用工行为进行监督检查，对违反劳动法律法规的行为进行查处。劳动者在投诉时，需要提交书面投诉材料，并附上相关证据。劳动监察部门在受理投诉后，会进行调查核实，如果情况属实，会责令用人单位限期支付差额部分工资，并可以对其处以罚款等行政处罚。
3. 申请劳动仲裁 如果劳动者对劳动监察部门的处理结果不满意，或者用人单位在劳动监察部门责令限期支付后仍不支付的，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种法定方式，其裁决具有法律效力。劳动者在申请劳动仲裁时，需要提交仲裁申请书、相关证据材料等。劳动争议仲裁委员会在受理仲裁申请后，会组成仲裁庭进行审理，并作出裁决。如果用人单位不履行仲裁裁决，劳动者可以向人民法院申请强制执行。

注意事项

1. 及时维权 劳动者在发现用人单位未按照薪资协议约定支付工资后，应当及时采取维权措施，避免超过法定时效。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
2. 保留证据 在整个维权过程中，劳动者需要保留好相关证据，以证明自己的主张。证据的完整性和真实性对于维权成功至关重要。如果证据不足或存在瑕疵，可能会影响劳动者的维权效果。
3. 合法维权 劳动者在维权过程中，应当遵守法律法规，不得采取过激行为或违法手段。否则，不仅可能无法维护自己的合法权益，还可能承担相应的法律责任。