元旦凌晨加班，确实有三倍工资。这一结论基于我国《中华人民共和国劳动法》的相关规定，以下从多个角度为您详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。元旦作为我国的法定节假日，仅元旦当天（1月1日）属于法定休假日。因此，若用人单位在这一天（包括凌晨）安排劳动者工作，必须按照不低于劳动者本人日或小时工资的300%支付加班工资。

二、加班工资的计算

1. 计算基数：加班工资的计算基数通常是劳动者的月工资，但具体数额可能因地区、行业或单位规定而有所不同。在计算时，应确保使用正确的基数。
2. 计算方式：若劳动者在元旦当天加班，其加班工资应不低于本人日或小时工资的300%。例如，若劳动者的日工资为200元，则元旦当天加班的加班工资应不低于600元。

三、特殊情况说明

1. 调休日加班：元旦假期通常包含三天，其中除元旦当天外，其余两天多为调休或通过周末连休得来。对于这两天，若用人单位安排加班且不能安排补休，则应支付不低于工资的200%的工资报酬，而非三倍工资。
2. 不定时工作制：对于实行不定时工作制的劳动者，由于其工作时间不受固定限制，通常不适用加班工资的规定。但若当地有特殊规定对不定时工作制在法定节假日的加班有特别规定，则应遵循当地规定执行。

四、权益保障与建议

1. 了解权益：劳动者应充分了解自己的合法权益，包括法定节假日加班应获得的三倍工资等。
2. 保留证据：若用人单位未按规定支付加班工资，劳动者应保留好相关证据，如加班记录、工资条等，以便在维权时提供有力支持。
3. 维权途径：若用人单位未依法支付加班工资，劳动者可首先尝试与用人单位协商解决。协商不成的，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，元旦凌晨加班确实有三倍工资，这是法律明确规定的权益。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取合适的措施维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。