结论前置：请年休假通常不会扣除全勤奖，但具体是否扣除需依据单位规章制度及劳动合同内容确定。若单位规定或合同约定休年休假会扣除全勤奖，且该规定或约定合法有效，则用人单位有权扣除全勤奖。
法律层面分析
年休假的法定性：
- 根据《职工带薪年休假条例》第二条的规定，职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。这是劳动者的法定权利，旨在保障劳动者的休息权益。在年休假期间，劳动者不仅享有休假的权利，还享有与正常工作期间相同的工资收入，且休假期间视为出勤。
全勤奖的考核标准与年休假的性质：
- 全勤奖通常是对员工在特定周期内（如整月）无迟到、早退、请假及旷工记录的一种奖励措施。其核心在于鼓励员工保持良好的出勤记录。
- 年休假是劳动者依法享有的假期，其申请和休假过程均遵循公司规定的流程，并经过批准。因此，年假与无故缺勤等违反出勤纪律的行为有本质区别，不应被纳入影响全勤奖评定的范畴。
单位规定与劳动合同的作用
- 单位可以依法制定规章制度，规定全勤奖金的发放条件。这些规定应当合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果劳动合同或单位规章制度中明确规定休年休假会扣除全勤奖，并且这些规定已经明确告知劳动者，同时不违反法律法规的强制性规定，那么这些规定对劳动者具有约束力。在这种情况下，用人单位有权按照规定扣除全勤奖。
实际操作建议
查看公司规定与劳动合同：
- 员工在入职时应仔细审查劳动合同中关于全勤奖金和年休假的相关规定。对于不明确的地方，应向单位的人力资源部门或相关负责人咨询清楚，以避免产生纠纷。
沟通协商：
- 若单位规定或合同约定休年休假会扣除全勤奖，但员工认为这一规定不合理或违法，应首先与单位进行沟通协商，表达自身合法权益的诉求。
维护权益：
- 协商不成时，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，员工应提供充分的证据证明自己的主张，如劳动合同、公司规章制度、工资条等。
特殊情况处理
- 若单位因员工休年休假而扣除全勤奖，且这一规定或约定存在不合理或违法之处（如未明确告知劳动者、违反法律法规的强制性规定等），员工有权拒绝接受这一处理结果，并寻求法律援助来维护自己的合法权益。
综上所述，请年休假是否会扣全勤奖金主要取决于单位的具体规定和劳动合同的约定。在一般情况下，年休假期间员工应享受与正常工作期间相同的工资待遇，包括全勤奖金等福利待遇。然而，如果单位有合法有效的规定或合同约定休年休假会扣除全勤奖，则用人单位有权按照规定执行。因此，员工在请年休假前应仔细了解相关规定和约定，以避免不必要的纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。