结论前置：
- 一般情况下，休年假不应扣全勤奖，因为年假是劳动者的法定权利，休假期间视为正常出勤，应享受与正常工作期间相同的工资待遇，包括全勤奖。
- 但具体是否扣除需依据单位规章制度及劳动合同内容确定。如果单位规章制度或劳动合同中明确规定休年假会扣除全勤奖，且该规定或约定合法有效（即经过民主程序制定，向劳动者公示或告知，且不违反法律法规的强制性规定），则用人单位有权扣除全勤奖。
法律背景与解析：
年假的法定性：
- 根据《职工带薪年休假条例》及相关法律法规，劳动者连续工作1年以上的，依法享受带薪年休假。这是劳动者的法定权利，旨在保障劳动者的休息权益。
- 年假期间，劳动者不仅享有休假的权利，还享有与正常工作期间相同的工资收入，且休假期间视为出勤。
全勤奖的考核标准：
- 全勤奖通常是对员工在特定周期内（如整月）无迟到、早退、请假及旷工记录的一种奖励措施。
- 由于年假是劳动者的法定待遇，且休假期间视为正常出勤，因此年假不应被视为影响全勤考核的因素。
单位规章制度与劳动合同的作用：
- 单位可以依法制定规章制度，规定全勤奖金的发放条件。
- 如果劳动合同或单位规章制度中明确规定休年休假会扣除全勤奖，并且这些规定已经明确告知劳动者，同时不违反法律法规的强制性规定，那么这些规定对劳动者具有约束力。
法律建议与可能后果：
对于劳动者：
- 在入职时，应仔细审查劳动合同中关于全勤奖金和年休假的相关规定，对于不明确的地方，应向单位的人力资源部门或相关负责人咨询清楚，以避免产生纠纷。
- 如果单位因员工休年休假而扣除全勤奖，员工应首先与单位协商沟通，要求按规定支付全勤奖。
- 协商不成时，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
对于用人单位：
- 在制定规章制度时，应确保规章制度内容合法、合理，且经过民主程序制定，向劳动者公示或告知。
- 避免将法定带薪假期（如年假、病假等）纳入影响全勤奖发放的范畴，以免引发不必要的法律纠纷。
举例说明：
- 假设某单位规章制度中规定：“员工休年休假期间，全勤奖照发。”那么，在该单位工作的员工休年休假时，用人单位就不得扣除其全勤奖。
- 反之，如果某单位规章制度中规定：“员工休年休假期间，全勤奖扣除。”且该规定已经明确告知劳动者，同时不违反法律法规的强制性规定，那么在该单位工作的员工休年休假时，用人单位就有权扣除其全勤奖。但这种情况较为少见，且可能引发劳动者的不满和法律纠纷。
综上所述，请年假是否扣全勤奖并非一成不变，而是需根据具体情况进行综合判断。劳动者和用人单位都应了解并遵守相关法律法规和规章制度，以确保双方的合法权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。