结论概述：员工同意转入新公司但旧公司以制度理由拒绝的情况，可能涉及劳动合同的变更、解除及经济补偿等多个法律问题。以下将从不同角度对此问题进行分析。

一、劳动合同变更的法律规定

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则。这意味着，如果员工同意转入新公司，实际上是在与旧公司协商变更劳动合同的工作地点或用人单位等关键条款。若旧公司以制度理由拒绝，且该制度并非合法合理且已向员工公示或告知的，那么旧公司的拒绝可能不构成合法理由。

分析：

1. 制度合法性：旧公司所依据的制度必须合法且合理，且已向员工公示或告知。如果制度本身存在违法或不合理之处，或者未向员工公示或告知，那么该制度不能作为拒绝员工转入新公司的合法依据。
2. 协商一致原则：劳动合同的变更需要双方协商一致。如果员工同意转入新公司，而旧公司拒绝，且拒绝理由不充分，那么旧公司可能构成违约，需要承担相应的法律责任。

二、旧公司拒绝的法律后果

如果旧公司无正当理由拒绝员工转入新公司，可能面临以下法律后果：

1. 经济补偿：根据《劳动合同法》的规定，如果因用人单位的原因导致劳动合同解除或变更，用人单位可能需要向员工支付经济补偿。具体补偿标准根据员工在旧公司的工作年限和工资水平确定。
2. 劳动争议处理：员工可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

三、员工应对策略

面对旧公司的拒绝，员工可以采取以下策略：

1. 与旧公司协商：首先尝试与旧公司进行沟通，了解拒绝的具体原因，并尝试协商解决方案。如果旧公司的制度确实存在问题，可以提出修改建议或寻求其他合理的解决方案。
2. 寻求法律援助：如果协商无果，员工可以寻求法律援助，咨询专业律师的意见，了解自己的权益和可能的法律途径。
3. 申请劳动争议处理：如果必要，员工可以向劳动争议调解委员会或仲裁委员会申请处理，维护自己的合法权益。

四、特殊情况考虑

1. 新公司是否愿意接收：在员工同意转入新公司的情况下，还需要考虑新公司是否愿意接收该员工，并与其签订新的劳动合同。如果新公司不愿意接收，那么员工可能需要重新考虑自己的职业规划。
2. 劳动合同的具体条款：在协商变更劳动合同的过程中，员工需要仔细审查新劳动合同的具体条款，确保自己的权益得到充分保障。特别是关于工资、福利、工作地点、工作时间等关键条款，需要与新公司进行充分协商并明确约定。

建议：面对此类问题，员工应保持冷静，首先尝试与旧公司进行协商，了解拒绝的具体原因并寻求解决方案。如果协商无果，可以寻求法律援助并申请劳动争议处理。同时，员工也需要考虑新公司的接收意愿和劳动合同的具体条款，确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。