合同中有仲裁条款一般不属于霸王条款，且在仲裁条款有效的情况下，当事人不能直接向法院起诉其无效，但在特定法定情形下，当事人可以向法院提起诉讼。以下是对此问题的详细分析：

一、仲裁条款的法律效力

仲裁条款是双方协商将争议交特定仲裁机构裁判的协议，具有法律约束力。一旦合同双方选择了以仲裁方式解决纠纷，就意味着放弃了通过法院诉讼的权利。有效的仲裁协议具有排除法院管辖权的效力，法院通常不会受理有合法有效仲裁协议的案件。因此，仲裁条款本身并不构成霸王条款，而是双方自愿选择的一种争议解决方式。

二、仲裁条款无效的情形

尽管仲裁条款具有法律效力，但在某些特定情形下，仲裁条款可能被视为无效。这些情形包括但不限于：

1. 仲裁机构不明确或不存在：如果仲裁条款中指定的仲裁机构不明确或不存在，那么该仲裁条款可能因无法执行而被视为无效。
2. 仲裁事项超出法律规定的仲裁范围：例如，涉及婚姻、收养、监护、抚养、继承等纠纷，这些事项通常不属于仲裁的范畴。
3. 存在法定无效情形：如无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议，或者一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议等。

在仲裁条款无效的情况下，当事人可以向法院提起诉讼，法院会依法受理。

三、放弃仲裁协议的情形

如果一方向法院起诉时，没有向法院声明双方存在仲裁协议，而另一方在首次开庭前也未对法院受理该案提出异议，那么这将被视为双方放弃了仲裁协议。此时，法院可以继续审理该案，当事人不能以仲裁条款为由拒绝法院的管辖。

四、仲裁裁决的撤销或不予执行

仲裁裁决作出后，并非终局。当事人如果认为仲裁裁决存在错误或违反法律规定等情况，可以向法院申请撤销或不予执行仲裁裁决。若法院裁定撤销或不予执行仲裁裁决，当事人可以就同一纠纷向人民法院提起诉讼。

五、实际操作建议

1. 审查仲裁条款的有效性：在处理涉及仲裁协议的纠纷时，当事人应首先审查仲裁条款的有效性。若仲裁条款有效，则应依约通过仲裁解决纠纷。
2. 考虑特定情形下的诉讼权利：若仲裁条款无效或存在其他特定情形（如放弃仲裁协议、仲裁裁决被撤销或不予执行等），则当事人可以考虑向法院提起诉讼。
3. 及时咨询与行动：在遇到复杂或不确定的法律问题时，建议及时向我咨询，以便获取更准确的法律意见和指导，避免错过行使权利的最佳时机。

综上所述，合同中有仲裁条款并不构成霸王条款，且在仲裁条款有效的情况下，当事人应遵守仲裁协议的约定。但在特定法定情形下，当事人仍有向法院提起诉讼的权利。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。