打卡公司与发工资公司不一样，这一行为本身并不直接构成违法，但可能涉及一些法律风险和合规问题，具体需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律背景与合规性分析
劳动关系认定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动关系的建立是基于劳动者与用人单位之间的事实劳动关系，而非仅仅基于打卡或工资发放的形式。因此，打卡公司与发工资公司不一致，并不直接决定劳动关系的归属。
- 如果劳动者实际上是与发工资的公司建立了劳动关系，而打卡公司只是代为管理考勤或提供工作场所，那么这种安排在法律上可能是允许的，但需要确保相关协议或合同中明确约定了双方的权利和义务。
工资支付义务：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位有义务按时足额支付劳动者工资。如果发工资的公司未履行这一义务，无论其是否与打卡公司一致，都可能构成违法。
- 如果打卡公司与发工资公司之间存在关联关系（如母子公司、分公司等），且发工资的公司未支付工资，劳动者有权要求打卡公司（或关联公司）承担连带责任，具体需根据实际情况和法律规定判断。
二、可能存在的法律风险与应对建议
法律风险：
- 劳动关系模糊：如果打卡公司与发工资公司不一致，且未明确约定劳动关系归属，可能导致劳动者在维权时面临困难。
- 工资支付纠纷：如果发工资的公司未按时足额支付工资，劳动者可能难以直接追究其责任，尤其是当发工资公司与打卡公司之间无明确关联时。
- 社保缴纳问题：如果打卡公司与发工资公司不一致，可能导致社保缴纳主体不明确，影响劳动者的社保权益。
应对建议：
- 明确劳动关系：劳动者应与用人单位（即实际支付工资的公司）签订书面劳动合同，明确双方的权利和义务，包括工资支付、社保缴纳等。
- 保留证据：劳动者应保留与工作相关的所有证据，如考勤记录、工资条、工作证等，以便在维权时提供有力支持。
- 及时维权：如果发现工资支付或社保缴纳存在问题，劳动者应及时向用人单位提出异议，并寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。
三、特殊情况下的法律分析
代发工资情况：
- 如果打卡公司受发工资公司委托代为发放工资，且双方之间有明确的委托协议，那么这种安排在法律上可能是允许的。但需确保委托协议中明确约定了双方的权利和义务，以及工资支付的准确性和及时性。
关联公司情况：
- 如果打卡公司与发工资公司之间存在关联关系（如母子公司、分公司等），且发工资公司未支付工资，劳动者有权根据《中华人民共和国公司法》等相关规定，要求打卡公司（或关联公司）承担连带责任。但需注意，具体责任承担需根据实际情况和法律规定判断。
综上所述，打卡公司与发工资公司不一样并不直接构成违法，但可能涉及一些法律风险和合规问题。劳动者应明确劳动关系归属、保留相关证据、及时维权，并在必要时寻求法律援助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。