当公司进入清算程序时，员工的权益保障，特别是经济补偿金的支付，是一个至关重要的环节。以下是对公司清算时员工赔偿问题的详细解答：
一、赔偿的法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法规，当公司被依法宣告破产或决定提前解散时，劳动合同将终止，且公司需向员工支付经济补偿。这一规定确保了员工在公司清算过程中的合法权益得到保护。
二、经济补偿金的计算标准
经济补偿金的计算主要依据员工在公司的工作年限和月平均工资：
工作年限：
- 每工作满一年，支付一个月工资的经济补偿。
- 工作年限六个月以上不满一年的，按一年计算，即支付一个月工资。
- 工作年限不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
月平均工资：
- 月平均工资是指员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，包括计时/计件工资、奖金、津贴等所有货币性收入。
- 若员工工作不满十二个月，则按实际工作的月数计算平均工资。
- 需要注意的是，若员工月工资高于当地职工月平均工资的三倍，则经济补偿金将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
三、特殊情形下的赔偿处理
拖欠工资与社保：
- 在公司清算过程中，清算组需优先清偿员工的工资、医疗/伤残补助、抚恤费用以及欠缴的社保费用。
未提前通知解除合同：
- 如果公司未按规定提前30日书面通知员工解除劳动合同，除支付正常的经济补偿外，还需额外支付一个月工资作为代通知金。
违法解除合同的赔偿金：
- 若公司违反法律规定解除合同，员工有权主张双倍经济补偿标准的赔偿金，即“2N”原则。
四、清算流程中的员工权益保障措施
成立清算组：
- 公司应在解散事由出现后15日内成立清算组，负责清理公司资产、编制资产负债表，并制定清偿方案。
公告与申报债权：
- 清算组需在报纸上公告，通知债权人（包括员工）申报债权。员工需在规定期限内提交工资证明等材料以申报债权。
分配剩余财产：
- 在清偿顺序中，员工工资及社保费用优先于税款和普通债权得到支付。
五、员工维权途径
协商与调解：
- 员工可以首先尝试与清算组进行协商，或通过劳动争议调解组织解决争议。
劳动仲裁：
- 若协商无果，员工可以向劳动合同履行地或公司所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，仲裁时效为一年。
法律诉讼：
- 对仲裁结果不服的员工，可以在15日内向法院提起诉讼，寻求法律救济。
六、注意事项
- 保留证据：员工应妥善保存劳动合同、工资条、考勤记录等材料，以备维权之需。
- 及时申报：员工需关注清算公告，按时申报债权，确保自己的权益得到及时保障。
- 法律咨询：在复杂情况下，建议员工寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的合法权益。
综上所述，公司清算时员工的经济补偿金计算是一个严谨且明确的过程。通过遵循相关法律法规和操作流程，可以确保员工的合法权益在公司清算过程中得到有效保障。