结论前置：公司以员工有过错为由扣员工保险赔偿金是否合法，需分情况讨论，一般情况下不合法，但特定情形下可能合法。以下为具体分析：

1. 保险赔偿金的性质与归属
   保险赔偿金（如工伤保险赔偿、商业保险理赔）的归属需根据保险类型和合同约定判断。若保险是公司为员工购买的法定社会保险（如工伤保险），赔偿金应直接支付给员工，公司无权扣减；若保险是公司额外购买的商业保险，需查看保险合同条款是否约定公司有权因员工过错扣减赔偿金。若合同无明确约定，公司扣减行为可能缺乏依据。

2. 员工过错与扣减的合法性关联
   即使员工存在过错（如故意或重大过失导致事故），公司扣减保险赔偿金也需满足以下条件：

   • 法定情形：如《工伤保险条例》规定，员工因故意犯罪、醉酒或吸毒、自残或自杀等情形导致工伤的，不享受工伤保险待遇。但此类情形下，公司是“不支付”而非“扣减”赔偿金，且需严格符合法律规定的条件。
     
   • 约定情形：若商业保险合同明确约定“员工过错导致事故的，公司可扣减部分赔偿金”，且该条款不违反法律强制性规定（如不显失公平），则公司扣减行为可能合法。但公司需证明员工过错与事故存在直接因果关系，且扣减比例合理。

3. 公司扣减行为的程序要求
   即使公司有权扣减赔偿金，也需履行法定程序：

   • 告知义务：公司需提前告知员工扣减依据（如合同条款、法律规定）及具体金额，避免单方面扣减引发纠纷。
     
   • 证据充分：公司需提供充分证据证明员工存在过错（如监控录像、事故报告、员工签字确认的过错说明等），否则可能因举证不能而承担不利后果。
     
   • 比例合理：扣减金额应与员工过错程度相适应，不得滥用权利。例如，员工轻微过失导致小额损失的，公司扣减全部赔偿金可能被认定为不合理。

4. 员工维权途径
   若公司扣减行为不合法，员工可通过以下方式维权：

   • 协商：与公司沟通，要求说明扣减依据并返还被扣金额。
     
   • 投诉：向劳动监察部门举报公司违法行为（如未依法缴纳社保、克扣工资等）。
     
   • 仲裁/诉讼：申请劳动仲裁或提起民事诉讼，要求公司返还被扣金额并赔偿损失。

总结：公司以员工过错为由扣减保险赔偿金是否合法，需结合保险类型、合同约定、过错程度及程序合规性综合判断。若您遇到此类问题，建议收集相关证据（如保险合同、扣减通知、过错证明等），并直接向我咨询具体维权方案。