针对您提出的“员工自离回来要工资怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、员工自离后的工资权益
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条和《工资支付暂行规定》第九条，劳动者为用人单位提供了劳动，无论离职原因如何，用人单位均有义务支付相应工资。因此，员工自离后，仍然有权要求用人单位支付其已提供劳动对应的工资。
二、工资核算与支付原则
工资核算：
- 工资计算应截止至员工实际工作的最后一天。
- 核算工资项目包括基本工资（按劳动合同约定的标准，根据实际出勤天数计算）、绩效工资（根据公司绩效考核标准和员工表现核算）、奖金（根据员工是否符合获奖条件确定是否发放）以及加班工资（平时加班1.5倍，周末加班2倍，法定节假日加班3倍）。
工资支付原则：
- 遵循按劳分配、合法合规、公平公正的原则。
- 在解除或终止劳动合同时，用人单位应一次性付清劳动者工资。
三、工资扣除的合法情况
法定扣除项：
- 个人所得税：根据国家税收法规代扣代缴。
- 社保和公积金：扣除员工个人应承担的部分。
其他合法扣除项（需有明确证据并符合规定）：
- 未归还借款：从工资中扣除相应金额。
- 经济损失赔偿：若员工自离给公司造成损失，可按要求从工资中扣除赔偿金额，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且剩余工资不得低于当地月最低工资标准。用人单位需承担举证责任。
四、解决工资问题的建议步骤
与用人单位协商：
- 首先尝试与用人单位沟通，要求支付应得工资，并保留好协商过程中的证据，如聊天记录、通话录音等。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，由其进行监督检查。用人单位可能面临限期支付工资、加付赔偿金的处罚。
申请劳动仲裁：
- 若投诉仍未解决问题，可提交仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明材料等，向劳动仲裁机构申请仲裁。劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
提起诉讼：
- 对仲裁结果不满意时，可在收到裁决书后十五日内向人民法院提起诉讼，通过司法途径维护自身权益。
五、特殊注意事项
- 在处理自离后工资问题时，员工应了解相关法律法规和劳动合同条款，明确自己的权利和义务。
- 保留好所有相关证据，如劳动合同、工资单、考勤记录、工作成果记录等，以备不时之需。
- 理性维权，避免采取过激行为或言语，以免给自己带来不必要的麻烦。
综上所述，员工自离后仍有权要求支付已提供劳动的工资。在处理过程中，建议员工先与用人单位协商，若协商无果则采取法律手段维护自身权益。同时，保留好所有相关证据，确保自己的权益得到充分保障。