刑法修正案在适用时遵循从旧兼从轻原则，一般情况下不溯及既往，但在特定条件下（新法对被告人更有利时）可以溯及既往。这一原则旨在平衡法的稳定性与公正性，确保公民权利得到保障，并体现刑法有利于被告人的精神。以下是对这一问题的详细分析：

一、从旧兼从轻原则的含义

从旧兼从轻原则是刑法适用中的一项重要原则，它包含两个层面：

1. 从旧：原则上应适用行为发生时的旧法，即法律不溯及既往。这一原则保障了公民基于旧有法律所形成的合理预期和行为的可预测性。例如，如果某人在刑法修正案生效前实施了某种行为，且当时的法律对该行为有明确的定罪和量刑规定，那么在审判时，首先应考虑适用当时的法律规定来处理案件。

2. 从轻：在新法规定比旧法更轻（包括定罪较轻、量刑较轻等）的情况下，应适用新法。这体现了刑法对被告人权益的尊重和保护。例如，如果刑法修正案对某种犯罪的处罚比行为时的法律更轻，或者修正案不再将某种行为视为犯罪，那么在审判时，就应适用刑法修正案来对其进行定罪量刑。

二、从旧兼从轻原则在刑法修正案中的具体适用

1. 原刑法不认为是犯罪，刑法修正案认为是犯罪的：

   • 在这种情况下，应遵循“从旧”原则，即适用原刑法规定，刑法修正案不具有溯及力。这是因为，公民在行为时依据的是当时的法律，若事后因法律修改而被追究刑事责任，将违背法的稳定性和公民的合理预期。

2. 原刑法认为是犯罪，但刑法修正案不认为是犯罪的：

   • 对于此类行为，如果案件尚未经过审判或判决尚未生效，则应适用“从轻”原则，即按照刑法修正案的规定处理，此时刑法修正案具有溯及力。这体现了刑法对被告人权益的特别保护。

3. 原刑法和刑法修正案都认为是犯罪：

   • 在这种情况下，应比较两部法律对同一行为规定的处罚轻重，并选择适用处罚较轻的规定。这既符合“从轻”原则，也体现了刑法的公正性和人道主义精神。

三、特殊情况的法律规定

根据《中华人民共和国刑法》第十二条的规定，对于本法施行以前已经作出的生效判决，即使按照刑法修正案的规定该行为不构成犯罪或处刑较轻，也应继续维持原判决的有效性。这是为了维护司法判决的稳定性和权威性。

四、实际案例说明

以贪污罪为例，假设某人在刑法修正案九生效前实施了贪污行为，且按照行为时的法律量刑可能较重。但刑法修正案九对贪污罪的量刑标准进行了调整，使得处罚相对变轻。那么，在审判时，如果案件尚未经过审判或判决尚未生效，就应适用刑法修正案九来对其进行定罪量刑，这体现了从轻原则的应用。

五、从旧兼从轻原则的核心价值与实践意义

从旧兼从轻原则的核心在于“利于被告方”，即在法律适用上优先选择对被告人更为有利的法律。这一原则不仅体现了刑法的人道主义精神和对被告人权益的尊重，也是法治国家建设中的重要一环。在司法实践中，法院会综合考虑案件的具体情况，严格遵循从旧兼从轻原则，以确保判决的公正性、合理性和可接受性。

综上所述，刑法修正案在适用时确实遵循从旧兼从轻原则，这一原则确保了法律的稳定性与公正性的平衡，保护了公民的合法权益，并体现了刑法的人文关怀和法治精神。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。