结论：护士长因护士不上夜班扣护士绩效是否合法，需根据具体情况判断，包括劳动合同、医院规章制度以及不上夜班的具体原因等。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同与规章制度的角度
劳动合同约定：
- 如果护士与医院签订的劳动合同中明确规定了护士需要上夜班，并且未上夜班将视为违反合同约定，医院有权根据合同条款采取相应的管理措施，包括扣减绩效。
- 反之，如果劳动合同中未明确规定上夜班的要求，或者规定了但未明确不上夜班的后果，那么医院单方面扣减绩效可能缺乏合同依据。
医院规章制度：
- 医院作为用人单位，有权制定内部规章制度来规范员工的行为。如果规章制度中明确规定了护士需要上夜班，并且未上夜班将扣减绩效，且该规章制度已经过民主程序制定并公示或告知了护士，那么医院的行为可能具有合法性。
- 但如果规章制度未经过民主程序制定，或者未公示或告知护士，那么该规章制度对护士不具有约束力，医院不能据此扣减绩效。
二、不上夜班的具体原因
合理原因：
- 如果护士因生病、怀孕、哺乳等合理原因无法上夜班，且已经按照医院规定履行了请假手续，那么医院不应扣减其绩效。因为这种情况下，护士不上夜班是出于不可抗力或合理原因，医院应给予理解和支持。
不合理原因：
- 如果护士无正当理由拒绝上夜班，且未按照医院规定履行请假手续，那么医院有权根据规章制度或劳动合同采取相应的管理措施，包括扣减绩效。但前提是这些措施必须合法、合理且经过民主程序制定。
三、法律建议
对于护士：
- 首先应查看自己的劳动合同和医院的规章制度，了解上夜班的要求以及不上夜班的后果。
- 如果因合理原因无法上夜班，应及时向医院说明情况并履行请假手续，以避免不必要的纠纷。
- 如果认为医院扣减绩效的行为不合法或不合理，可以向医院提出异议或向劳动监察部门投诉。
对于医院：
- 应确保劳动合同和规章制度的合法性和合理性，并经过民主程序制定并公示或告知护士。
- 在采取管理措施时，应遵循合法、合理、公正的原则，避免侵犯护士的合法权益。
- 如果护士提出异议或投诉，应积极应对并妥善处理，以维护医院的声誉和员工的权益。
总结：护士长因护士不上夜班扣护士绩效是否合法，需根据劳动合同、医院规章制度以及不上夜班的具体原因等综合判断。如果护士因合理原因无法上夜班且已履行请假手续，医院不应扣减其绩效；如果护士无正当理由拒绝上夜班且未履行请假手续，医院有权根据规章制度或劳动合同采取相应的管理措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。