离职时删除公司程序可能构成违法，具体后果取决于程序的权属、删除行为对公司的影响以及是否存在相关协议约定。以下是对此问题的详细分析：
一、程序的权属判断
职务成果归属公司：
- 员工在工作期间，主要利用公司的物质技术条件、按照公司的任务要求开发完成的程序，属于职务作品或职务发明创造，其知识产权归公司所有。这意味着，即使程序是员工个人编写的，但如果使用了公司资源（如设备、技术资料、工作时间等），其所有权也可能属于公司。
- 法律后果：若员工擅自删除属于公司的程序，可能构成对公司财产权的侵害，需承担相应的法律责任。
个人所有：
- 如果程序是员工在业余时间，完全利用自己的资源开发的，并且与公司的工作任务无关，那么该程序的所有权属于员工个人。但需注意，如果此前与公司签订了相关协议（如劳动合同、保密协议、竞业禁止协议等），且协议中有关于工作成果归属的约定，员工仍需遵守。
- 法律后果：在符合上述个人所有条件且无相关协议约束的情况下，员工删除自己所有的程序通常不构成违法。但若存在相关协议，则可能因违约而需承担法律责任。
二、法律责任分析
民事责任：
- 侵权责任：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果员工擅自删除属于公司的程序，给公司造成了损失，公司有权要求员工承担相应的侵权责任。赔偿责任可能包括重新开发程序的费用、业务停滞造成的损失等直接经济损失。
- 违约责任：如果员工与公司之间签订了相关协议，且协议中有禁止离职时删除某些工作相关内容的约定，那么员工的删除行为可能构成违约，公司有权依据协议要求员工承担违约责任，如支付违约金等。
刑事责任：
- 在某些情况下，如果删除程序对公司正常的生产经营活动造成了严重影响，甚至导致公司无法正常运转，这一行为可能构成破坏生产经营罪或其他相关刑事犯罪。
- 如果程序涉及公司核心业务、商业秘密，删除行为给公司造成重大经济损失，员工还可能面临故意毁坏财物罪或侵犯商业秘密罪的刑事指控。依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，这些罪名可能带来严重的刑事处罚，包括有期徒刑和罚金。
三、实际建议与警示
- 权属明确：在离职前，员工应与公司明确程序的权属问题，避免后续纠纷。这可以通过查阅劳动合同、保密协议等相关文件，或与公司相关部门进行沟通确认。
- 充分沟通：与公司进行充分沟通，了解公司对程序的需求和期望，并按照公司要求完成工作交接。这有助于维护良好的职场关系，并避免不必要的法律风险。
- 遵守协议：严格遵守与公司签订的相关协议，不得擅自删除或破坏公司的数据或程序。如果协议中有关于工作成果归属、离职时工作交接等条款，员工应认真履行。
- 法律途径解决争议：如果与员工之间存在关于程序所有权的争议或纠纷，应通过合法的途径进行解决，如协商、调解或诉讼等。避免采取过激行为，以免加重法律责任。
综上所述，离职时删除公司程序是一个需要谨慎对待的问题。员工应充分了解程序的权属情况、法律责任以及职业道德要求，并在离职前与公司进行充分沟通和妥善处理相关事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。