关于“农民工工资业主是否需要盖章”的问题，这主要取决于具体的工资支付流程和所在地区的具体规定。以新疆维吾尔自治区建立的工程建设项目农民工工资支付离场结算确认制度为例，我们可以详细解释这一流程：

在新疆的离场确认制度中，当工程建设项目整体停工、竣工，或者项目阶段性完工、农民工因个人原因或用工需求需离场，以及总包单位、分包单位与农民工解除或终止劳动关系、签订的用工协议到期时，农民工需要与施工总承包单位（总包单位）和分包单位共同完成工资结算和责任确认。

这一过程中，分包单位会负责联合总包单位的劳资专管员，依据劳动用工实名制考勤记录和工作任务完成清单，核定农民工离场前的实际工作量，并据此计算应发工资总额，同时核对已支付工资，确定是否有未结清工资。

接下来，分包单位会填写《工程建设项目农民工工资支付离场结算确认书》，这份确认书会逐项明确农民工的入场时间、工种、工资标准、核定工作量、应发工资、已支付金额、未结清金额、未结清工资支付时间及方式等信息。这份确认书需要经过农民工本人、分包单位负责人、总包单位劳资专管员三方签字确认，并且需要加盖分包单位和总包单位的公章，一式三份，三方各执一份。

从这一流程中我们可以看出，在农民工工资支付离场结算确认的过程中，业主（在这里可以理解为总包单位或项目业主方，具体取决于项目结构和合同约定）作为总包单位的一部分，其公章是需要被加盖在确认书上的，以确保工资结算的正式性和有效性。当然，如果业主方与总包单位是同一实体，那么加盖总包单位的公章即代表了业主方的确认。

此外，如果农民工工资已经结清，确认书中会注明“工资已全部结清，双方无工资争议”，以避免后续纠纷；如果工资未结清，则会明确支付时间及方式，并由总包单位对支付过程进行监督，确保按期足额支付到位。

总的来说，农民工工资支付离场结算确认是一个涉及多方参与和确认的正式流程，其中业主（或总包单位）的盖章是确保流程正式性和有效性的重要环节。