结论：公司资金被职务侵占后，剩下的钱是否可以通过民事诉讼来追回，需根据具体情况判断。若职务侵占行为构成犯罪，一般优先考虑通过刑事诉讼及附带民事诉讼来维护权益；若不构成犯罪或刑事程序无法充分弥补损失，则可通过独立民事诉讼来寻求救济。

详细分析：

1. 职务侵占行为的性质

   • 职务侵占罪是指公司、企业或其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，且数额较大的行为。这属于刑事犯罪范畴，应由公安机关立案侦查，并由人民检察院提起公诉以追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

2. 刑事诉讼与附带民事诉讼

   • 在职务侵占案件的刑事诉讼过程中，被害人（通常是公司）有权通过刑事附带民事诉讼的方式，要求被告人返还被侵占的财物，并赔偿因其犯罪行为而遭受的物质损失。这种方式允许在刑事诉讼的同时解决民事赔偿问题，提高诉讼效率。
   • 但需注意，根据《最高人民法院关于刑事附带民事诉讼范围问题的规定》，在职务侵占罪案件中，被害人不能直接提起附带民事诉讼要求赔偿物质损失中的“预期利益”等，而是应通过刑事程序中的追缴或责令退赔来处理实际损失。不过，对于因职务侵占行为导致的直接物质损失（如实际被侵占的资金），仍可在附带民事诉讼中主张。

3. 民事诉讼的独立性

   • 如果职务侵占行为不构成犯罪，仅构成普通的民事侵权纠纷（例如，虽涉及公司内部人员在职务活动中侵犯公司财产权益，但未达到职务侵占罪的入罪标准），那么公司等权利人完全可以通过普通民事诉讼程序，以侵权责任纠纷等案由，直接向法院提起诉讼，要求侵权人返还财产、赔偿损失。
   • 即便职务侵占行为构成犯罪，受害人也有权选择单独提起民事诉讼，要求侵权人承担民事赔偿责任。这种情况下，民事诉讼和刑事诉讼可以分别进行，互不影响。特别是在刑事诉讼中未能充分追回损失的情况下，民事诉讼可以作为一种补充手段。

4. 诉讼时机的选择与注意事项

   • 若选择提起附带民事诉讼，应在刑事案件立案后及时提出，以确保诉讼的顺利进行。
   • 同时，我国刑法规定，犯罪分子违法所得的一切财物及其孳息应予以追缴或责令退赔，对被害人的合法财产应及时返还。因此，在能够通过刑事程序有效追回损失的情况下，可能无需再单独提起民事诉讼。
   • 在提起民事诉讼时，公司需注意诉讼时效问题（一般为三年，从知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算），并保留好相关证据材料（如职务侵占行为的证明材料、损失计算依据等），以便在诉讼中有效证明自己的主张。

建议：

• 在处理此类案件时，公司应首先向公安机关报案，由公安机关立案侦查并追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
• 同时，公司可以咨询专业律师（即我），评估是否可以通过附带民事诉讼或单独提起民事诉讼来追回剩余损失。
• 根据案件具体情况和律师建议，选择合适的维权途径以最大程度地保护公司权益。

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