结论：公司非法经营且收入均为非法所得的情况下，能否起诉职务侵占，需分情况讨论，不能一概而论。

分析：

1. 职务侵占罪的构成要件：

   • 职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。
   • 构成该罪的关键在于：一是行为人必须是公司、企业或其他单位的工作人员；二是行为人利用了职务上的便利；三是行为人将本单位财物非法占为己有；四是数额较大。

2. 非法经营与职务侵占的关系：

   • 非法经营是指违反国家规定，未经许可经营专营、专卖物品或其他限制买卖的物品，或者买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件，以及从事其他非法经营活动，扰乱市场秩序，情节严重的行为。
   • 非法经营本身并不直接决定能否起诉职务侵占。关键在于，在非法经营的过程中，是否存在公司、企业或其他单位的工作人员利用职务便利，将本单位（包括非法经营所得的财物，若视为单位财物的一部分）财物非法占为己有的行为。

3. 非法所得能否作为职务侵占的对象：

   • 理论上，如果非法经营所得被视为公司、企业或其他单位的财物（尽管其来源非法），且工作人员利用职务便利将其非法占为己有，数额较大，那么这种行为可能构成职务侵占罪。
   • 然而，在实践中，由于非法经营所得的合法性存疑，以及可能涉及其他法律问题（如洗钱、逃税等），因此起诉职务侵占可能会面临一些法律上的复杂性和挑战。

4. 具体案例与司法实践：

   • 在司法实践中，对于非法经营所得能否作为职务侵占的对象，可能因地区、案件具体情况和司法解释的不同而有所差异。
   • 有些案例可能认为，即使财物来源非法，但只要被单位实际控制和管理，就应视为单位财物，可以成为职务侵占的对象。
   • 而有些案例则可能持相反观点，认为非法经营所得不应被视为单位财物，因此不能起诉职务侵占。

建议：

• 如果您面临类似情况，建议首先收集相关证据，包括非法经营的证据、职务侵占的证据等。
• 然后，咨询专业律师（即我，李再庆律师，专注于建设工程、公司事务领域），根据具体情况和当地司法实践，评估起诉职务侵占的可行性和风险。
• 最后，根据律师的建议，决定是否提起诉讼以及如何提起诉讼。

进一步思考：

• 在起诉职务侵占之前，还需要考虑其他可能的法律后果和风险，如非法经营罪的追究、洗钱罪的追究等。
• 因此，在决定起诉之前，务必进行全面的法律分析和风险评估。

如果您有任何关于公司法务方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。