在行政协议纠纷中，原告主体主要包括行政行为的相对人以及与行政行为有利害关系的公民、法人或其他组织。以下是对这两类主体的详细阐述：

1. 行政行为的相对人：

   • 定义：行政行为的相对人是指行政机关在作出行政行为时直接针对的对象。在行政协议中，这通常指的是与行政机关签订协议的一方当事人。
   • 示例：若政府与某企业签订了一份土地使用权出让协议，后因政府原因导致协议无法履行，该企业作为行政行为的相对人，有权作为原告提起行政诉讼，要求政府承担违约责任或赔偿损失。

2. 与行政行为有利害关系的其他主体：

   • 定义：这类主体并非行政行为的直接相对人，但因行政行为而间接受到影响，且认为其合法权益受到侵犯。在行政协议纠纷中，这可能包括因协议履行而受到影响的第三方，如相邻权人、公平竞争权人等。
   • 示例：
     • 相邻权人：若行政机关与某企业签订的协议涉及土地开发，且该开发行为可能影响到相邻方的通风、采光、通行等权利，相邻方可作为原告起诉行政机关或企业，要求停止侵害或赔偿损失。
     • 公平竞争权人：在行政机关授予某企业特许经营权或独家经营权的协议中，若其他竞争者认为该协议破坏了市场公平竞争秩序，侵害了其合法权益，受侵害的竞争者可提起行政诉讼。

特殊情形下的原告主体资格：

• 行政复议申请人：若当事人对行政机关的决定不服并申请行政复议，但对复议结果仍不满意的，可以以原告身份提起行政诉讼。
• 公民死亡或法人、其他组织终止：有权提起诉讼的公民死亡后，其近亲属（如配偶、父母、子女等）可继承其诉讼权利，提起诉讼；法人或其他组织终止后，承受其权利的法人或其他组织可提起诉讼。

法律背景与建议：

• 在行政协议纠纷中，确定原告主体资格的关键在于理解“法律上直接的利害关系”。只要公民、法人或其他组织认为行政机关的行政行为（包括行政协议）侵犯了其合法权益，并且符合法律规定的条件，即有可能成为行政诉讼的原告。
• 鉴于行政协议纠纷的复杂性和专业性，建议当事人在遇到此类纠纷时，及时咨询专业律师，以便准确判断自己的原告主体资格，并依法维护自身权益。

如有任何关于行政协议纠纷或其他法律问题，欢迎直接向我咨询。