结论：父亲生前所立的遗嘱，即便经过公证但未将儿子列为继承人，仅指定两个女儿继承，该遗嘱在符合法定形式和实质要件的情况下，仍然是有效的。
分析说明：
遗嘱的有效性要件：
- 形式要件：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，遗嘱可以采用自书遗嘱、代书遗嘱、录音遗嘱、口头遗嘱、公证遗嘱等多种形式。其中，公证遗嘱是由遗嘱人经公证机构办理的遗嘱，具有较高的法律效力。只要遗嘱在形式上符合法律要求，如公证遗嘱的公证程序合法，那么该遗嘱在形式上就是有效的。
- 实质要件：遗嘱的实质要件包括遗嘱人必须具有完全民事行为能力，遗嘱内容必须是遗嘱人的真实意思表示，且遗嘱内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。在您所描述的情况下，如果父亲在立遗嘱时具备完全民事行为能力，且遗嘱内容是其真实意思表示，没有违反法律或公序良俗，那么该遗嘱在实质上也是有效的。
遗嘱中未列明儿子的影响：
- 遗嘱的效力并不取决于是否列明了所有法定继承人。遗嘱人有权根据自己的意愿自由处分其财产，可以选择将财产留给部分或全部法定继承人，也可以选择将财产留给法定继承人以外的人。因此，即使遗嘱中未列明儿子，只要遗嘱符合法定形式和实质要件，就不影响其效力。
- 儿子作为法定继承人之一，如果未被遗嘱列为继承人，那么在遗嘱生效后，他将无法依据遗嘱继承父亲的财产。但这并不意味着他完全丧失了继承权，如果遗嘱无效或遗嘱未处分的遗产部分，他仍可能依据法定继承的规定继承相应份额。不过，就您所描述的情况而言，遗嘱已经明确指定了两个女儿为继承人，且未提及儿子，因此儿子在遗嘱范围内的财产将无法继承。
公证遗嘱的特殊效力：
- 公证遗嘱在遗嘱形式中具有较高的法律效力。根据《中华人民共和国民法典》的规定，遗嘱人以不同形式立有数份内容相抵触的遗嘱，其中有公证遗嘱的，以最后所立公证遗嘱为准。这意味着，如果父亲在生前立有多份遗嘱，且其中有一份是公证遗嘱，那么在遗嘱继承时，将以公证遗嘱为准。
行动建议：
- 如果儿子对遗嘱的效力或内容有异议，或者认为遗嘱的订立过程存在瑕疵（如父亲在立遗嘱时缺乏民事行为能力、遗嘱内容非父亲真实意思表示等），他可以通过法律途径寻求救济，如向法院提起遗嘱继承纠纷诉讼。
- 在处理此类纠纷时，建议儿子咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果和救济途径。
法律背景：
- 《中华人民共和国民法典》第一千一百三十三条：“自然人可以立遗嘱将个人财产指定由法定继承人中的一人或者数人继承。自然人可以立遗嘱将个人财产赠与国家、集体或者法定继承人以外的组织、个人。自然人可以依法设立遗嘱信托。”
- 《中华人民共和国民法典》第一千一百四十二条：“遗嘱人可以撤回、变更自己所立的遗嘱。立遗嘱后，遗嘱人实施与遗嘱内容相反的民事法律行为的，视为对遗嘱相关内容的撤回。立有数份遗嘱，内容相抵触的，以最后的遗嘱为准。”
- 《中华人民共和国民法典》第一千一百四十三条：“无民事行为能力人或者限制民事行为能力人所立的遗嘱无效。遗嘱必须表示遗嘱人的真实意思，受欺诈、胁迫所立的遗嘱无效。伪造的遗嘱无效。遗嘱被篡改的，篡改的内容无效。”
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