挂靠车辆因车主原因导致的误营运费，一般由车主承担，但具体还需根据挂靠协议的约定以及实际情况来判断。以下从不同角度进行分析：
一、挂靠协议有约定的情况
在挂靠经营关系中，车主与被挂靠单位通常会签订挂靠协议，明确双方的权利和义务。如果挂靠协议中明确约定了因车主原因导致的误营运费由车主承担，那么根据协议约定，车主应当承担这部分费用。这是因为挂靠协议是双方真实意思的表示，具有法律约束力，双方应当按照协议履行各自的义务。
二、挂靠协议无约定或约定不明的情况
车主过错导致误营运：
- 如果挂靠协议中没有约定误营运费的承担方式，或者约定不明确，但误营运是由于车主的过错（如车主未按时进行车辆维护、未遵守交通规则导致事故等）导致的，那么根据公平原则和过错责任原则，车主应当承担误营运费。这是因为车主的过错行为直接导致了营运的中断或减少，车主应当对其过错行为造成的损失承担责任。
非车主过错导致误营运：
- 如果误营运并非由于车主的过错导致，而是由于被挂靠单位的原因（如被挂靠单位未按时提供营运证件、未履行维修义务等）或者其他不可抗力因素（如自然灾害、政府行为等）导致的，那么误营运费可能不应由车主承担。在这种情况下，车主可以与被挂靠单位协商解决，或者根据实际情况向相关责任方主张权利。
三、实际操作中的建议
审查挂靠协议：
- 车主在签订挂靠协议时，应当仔细审查协议条款，特别是关于误营运费承担方式的约定。如果协议中有明确约定，车主应当按照约定履行义务；如果协议中没有约定或者约定不明确，车主可以与被挂靠单位协商补充约定。
保留相关证据：
- 在发生误营运情况时，车主应当保留相关证据，如维修记录、事故认定书、营运损失证明等。这些证据将有助于车主在后续协商或诉讼中证明自己的主张。
寻求法律帮助：
- 如果车主与被挂靠单位在误营运费承担问题上无法达成一致意见，车主可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式解决争议。在这种情况下，车主应当咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
总结来说，挂靠车辆因车主原因导致的误营运费，一般由车主承担，但具体还需根据挂靠协议的约定以及实际情况来判断。车主在签订挂靠协议时应当仔细审查协议条款，并在发生误营运情况时保留相关证据，以便在后续协商或诉讼中维护自己的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。