工程竣工决算后若出现合同变更，核心处理方式需根据变更性质及双方约定分情况处理，具体如下：

1. 若合同变更内容属于“可调整范围”且双方已书面确认
   根据《民法典》第543条，当事人协商一致可变更合同。若工程竣工决算后，双方通过补充协议、签证单等书面形式对原合同内容（如工程量、价款、工期等）进行变更，且变更内容不违反法律强制性规定（如未突破招投标文件实质性条款），则变更部分应按新约定执行。例如：因设计优化导致工程量增加，双方签署补充协议明确新增价款，此时决算金额需叠加变更部分重新核算。

2. 若合同变更未书面确认，但实际已履行且对方接受
   根据《民法典》第490条，法律、行政法规规定或当事人约定采用书面形式订立合同，当事人未采用书面形式但一方已履行主要义务，对方接受时，合同成立。若工程变更已实际施工（如新增隐蔽工程），且发包方未提出异议并验收合格，可视为双方以实际行为变更合同，承包方有权主张变更部分价款。但需注意：此类情形需保留施工记录、验收单、沟通记录等证据，否则可能因举证不足承担不利后果。

3. 若合同变更违反法律强制性规定或损害第三方利益
   若变更内容涉及“黑白合同”（如规避招投标程序）、降低工程质量标准、损害农民工权益等，根据《民法典》第153条，违反法律、行政法规强制性规定的民事法律行为无效。此时变更条款无效，双方应按原合同及法定标准结算。例如：发包方为降低成本要求承包方使用劣质材料，此类变更因违法无效，承包方有权拒绝并主张按原合同履行。

实务建议：

• 书面留痕：任何变更均需通过补充协议、签证单、会议纪要等形式书面确认，避免口头约定；
  
• 证据固定：若未书面确认，需保存施工日志、材料采购单、验收报告、沟通记录等证据，证明变更事实；
  
• 专业审核：涉及重大变更（如价款调整超10%、工期延长超30日）时，建议委托造价鉴定机构出具专业意见，避免结算争议。
  

若您遇到具体变更情形（如变更内容、争议焦点等），可进一步向我说明，我会结合细节为您分析处理方案。